Organization
Graduate School of Nanobioscience Department of Life and Environmental System Science Assistant Professor
School of Science Department of Science
School of Science Department of Science
Title
Assistant Professor
External link
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Kaoru Tonosaki
Degree
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博士（農学） ( 東北大学 )
Research Interests
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イネ
-
ポリコーム
-
エピジェネティクス
-
種間雑種
-
ゲノムインプリンティング
-
胚乳
-
生殖的隔離
Research Areas
-
Environmental Science/Agriculture Science / Science in plant genetics and breeding
Education
-
Tohoku University Graduate School of Agricultural Science Division of Life Science
- 2014.3
Research History
-
Yokohama City University Assistant Professor
2022.4
-
Iwate University Faculty of Agriculture
2019.12 - 2022.3
-
Yokohama City University
2019.4 - 2019.11
-
カリフォルニア大学デイビス校 ゲノムセンター 客員研究員
2017.10 - 2019.3
-
Yokohama City University
2014.4 - 2019.3
Professional Memberships
-
日本遺伝学会
-
JAPANESE SOCIETY OF BREEDING
Papers
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Epigenetic regulation in horticultural crops Reviewed
Keita Nishimura, Junji Miyazaki, Yoshinobu Takada, Mst. Arjina Akter, Kishore Kumar Sarker, Akhi Paul Chowdhury, Kaoru Tonosaki, Kenji Osabe, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto
The Horticulture Journal, accepted 2025.5
-
Takumi Adachi, Haruna Okamoto, Yoko Shiroto, Mizuki Murakami, Chika Tateda, Motoki Shimizu, Kaoru Tonosaki, Katsunori Hatakeyama
The Horticulture Journal 2025
-
Multilayered epigenetic control of persistent and stage-specific imprinted genes in rice endosperm Reviewed
Kaoru Tonosaki, Daichi Susaki, Hatsune Morinaka, Akemi Ono, Hiroki Nagata, Hiroyasu Furuumi, Ken-Ichi Nonomura, Yutaka Sato, Keiko Sugimoto, Luca Comai, Katsunori Hatakeyama, Taiji Kawakatsu, Tetsu Kinoshita
Nature Plants 2024.7
-
Polycomb repression of the asexual embryo. International journal
Kaoru Tonosaki, Tetsu Kinoshita
Nature plants 2023.10
-
Will epigenetics be a key player in crop breeding? Reviewed
Kaoru Tonosaki, Ryo Fujimoto, Elizabeth S. Dennis, Victor Raboy, Kenji Osabe
Frontiers in Plant Science 13 2022.9
-
Comparative Evaluation of Three Commercial Quantitative Real-time PCRs used in Japan for Bovine Leukemia Virus Reviewed International journal
Syuji Yoneyama, Sota Kobayashi, Towa Matsunaga, Kaoru Tonosaki, Dongze Leng, Yusuke Sakai, Shinji Yamada, Atsushi Kimura, Toshihiro Ichijo, Hirokazu Hikono, Kenji Murakami
Viruses 14 ( 6 ) 2022.5
-
Hiroki Nagata, Akemi Ono, Kaoru Tonosaki, Taiji Kawakatsu, Yutaka Sato, Kentaro Yano, Yuji Kishima, Tetsu Kinoshita
The Plant Journal 109 ( 5 ) 1035 - 1047 2022.2
-
Katsunori Hatakeyama, Shota Yuzawa, Kaoru Tonosaki, Yoshihito Takahata, Satoru Matsumoto
Breeding Science 2022
-
Kaoru Tonosaki, Akemi Ono, Megumi Kunisada, Megumi Nishino, Hiroki Nagata, Shingo Sakamoto, Saku T Kijima, Hiroyasu Furuumi, Ken-Ichi Nonomura, Yutaka Sato, Masaru Ohme-Takagi, Masaki Endo, Luca Comai, Katsunori Hatakeyama, Taiji Kawakatsu, Tetsu Kinoshita
The Plant Cell 2021.11
-
Cubam receptor-mediated endocytosis in hindgut-derived pseudoplacenta of a viviparous teleost Xenotoca eiseni Reviewed International journal
Atsuo Iida, Kaori Sano, Mayu Inokuchi, Jumpei Nomura, Takayuki Suzuki, Mao Kuriki, Maina Sogabe, Daichi Susaki, Kaoru Tonosaki, Tetsu Kinoshita, Eiichi Hondo
Journal of Experimental Biology 224 ( 13 ) jeb242613 2021.6
-
Endosperm Development Reviewed
Tonosaki K, Kinoshita T
eLS https://doi.org/10.1002/9780470015902.a0020098.pub2 2018.6
-
Overcoming the species hybridization barrier by ploidy manipulation in the genus Oryza Reviewed
Kaoru Tonosaki, Daisuke Sekine, Takayuki Ohnishi, Akemi Ono, Hiroyasu Furuumi, Nori Kurata, Tetsu Kinoshita
Plant Journal 93 ( 3 ) 534 - 544 2018.2
-
The importance of reproductive barriers and the effect of allopolyploidization on crop breeding Reviewed
Kaoru Tonosaki, Kenji Osabe, Takahiro Kawanabe, Ryo Fujimoto
Breeding Science 66 ( 3 ) 333 - 349 2016
-
Possible roles for polycomb repressive complex 2 in cereal endosperm Reviewed
Kaoru Tonosaki, Tetsu Kinoshita
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 6 ( 5 ) 144 2015.3
-
Draft Sequences of the Radish (Raphanus sativus L.) Genome Reviewed
Hiroyasu Kitashiba, Feng Li, Hideki Hirakawa, Takahiro Kawanabe, Zhongwei Zou, Yoichi Hasegawa, Kaoru Tonosaki, Sachiko Shirasawa, Aki Fukushima, Shuji Yokoi, Yoshihito Takahata, Tomohiro Kakizaki, Masahiko Ishida, Shunsuke Okamoto, Koji Sakamoto, Kenta Shirasawa, Satoshi Tabata, Takeshi Nishio
DNA RESEARCH 21 ( 5 ) 481 - 490 2014.10
-
The use of species-specific DNA markers for assessing alien chromosome transfer in Brassica rapa and Brassica oleracea-monosomic additions of Raphanus sativus Reviewed
Kaoru Tonosaki, Michiko Akaba, Sang Woo Bang, Hiroyasu Kitashiba, Yukio Kaneko, Takeshi Nishio
MOLECULAR BREEDING 34 ( 3 ) 1301 - 1311 2014.10
-
Haplotype C of growth hormone (GH) gene in Japanese Black cattle: Structure of GH protein and a novel method for detection of the gene Reviewed
Abolfazl Bahrami, Astrid Ardiyanti, Kaoru Tonosaki, Keiichi Suzuki, Nanako Tanida, Takuji Hirayama, Sang-Gun Roh, Takeshi Nishio, Kazuo Katoh
ANIMAL SCIENCE JOURNAL 84 ( 12 ) 802 - 804 2013.12
-
S genotyping in Japanese plum and sweet cherry by allele-specific hybridization using streptavidin-coated magnetic beads Reviewed
Chun-Lei Wang, Zhi-Ping Zhang, Kaoru Tonosaki, Hiroyasu Kitashiba, Takeshi Nishio
PLANT CELL REPORTS 32 ( 4 ) 567 - 576 2013.4
-
Genetic analysis of hybrid seed formation ability of Brassica rapa in intergeneric crossings with Raphanus sativus Reviewed
K. Tonosaki, K. Michiba, S. W. Bang, H. Kitashiba, Y. Kaneko, T. Nishio
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 126 ( 3 ) 837 - 846 2013.3
-
Allele-specific hybridization using streptavidin-coated magnetic beads for species identification, S genotyping, and SNP analysis in plants Reviewed
Kaoru Tonosaki, Junpei Kudo, Hiroyasu Kitashiba, Takeshi Nishio
Molecular Breeding 31 ( 2 ) 419 - 428 2013
-
Identification of species in tribe Brassiceae by dot-blot hybridization using species-specific ITS1 probes Reviewed
K. Tonosaki, Takeshi Nishio
Plant Cell Reports 29 ( 10 ) 1179 - 1186 2010
MISC
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Genetic and breeding studies on the mechanism of hybridization barrier in rice endosperm
Kaoru Tonosaki
Breeding Research 26 ( 2 ) 148 - 150 2024
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Overcoming the hybridization barrier in interspecific hybrid seeds from a cross between Oryza sativa and O. officinalis using the Osemf2a mutant
櫻井楓也, 殿崎薫, 古海弘康, 佐藤豊, 木下哲
育種学研究 26 2024
-
植物の種間交雑で見られるオス・メスゲノムのコンフリクト
殿崎薫, 木下哲
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024
-
イネ胚乳における雄性インプリント遺伝子の多層的な制御
殿崎薫, 木下哲
日本遺伝学会大会プログラム要旨集(CD-ROM) 96th 2024
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Double mutant for PRC2 components induces asexual embryogenesis and/or autonomous endosperm development
殿崎薫, 木下哲
育種学研究 25 2023
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Breaking down reproductive isolation in Oryza sativa×O. australiensis hybrid endosperm by H3K27me3 level modification
黒坂絵美, 中山怜南, 古海弘康, 佐藤豊, 木下哲, 畠山勝徳, 殿崎薫
育種学研究 25 2023
-
The attraction of <i>Oryza</i>, II
Koide Yohei, Fujita Daisuke, Ishikawa Ryo, Yamagata Yoshiyuki, Shiono Katsuhiro, Shimizu Motoki, Tonosaki Kaoru, Yoshikawa Takanori
Breeding Research advpub 2025
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Clubroot resistance of Brassica rapa plants harboring two NLR genes localized at Crr1b
畠山勝徳, 秋田谷茉那, 高橋美佐子, 塚崎素子, 殿崎薫, 清水元樹, 松元哲
育種学研究 26 2024
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シロイヌナズナにおける父母インプリント遺伝子による胚乳発達の制御
和田七夕子, 山口翔, 下保瑶己, 山口京, 山田慧士朗, 海老原諒子, 逢阪悠夏, 山崎聖翔, 殿崎薫, 肥後あすか, 辻寛之, 高山誠司, 木下哲, 伊藤寿朗
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024
-
Analysis of DNA demethylase mutants in rice
上地真子, 永田博基, 浅井一希, 福田友一, 小野明美, 遠藤真咲, 殿崎薫, 木下哲
育種学研究 26 2024
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Understanding of reproductive isolation mechanisms for breeding applications of wild rice
殿崎薫
育種学研究 26 2024
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Transcriptome analysis of the hybrid endosperm overcoming the hybridization barrier in an interspecific cross with wild rice
櫻井楓也, 黒坂絵美, 古海弘康, 佐藤豊, 畠山勝徳, 殿崎薫, 木下哲
育種学研究 26 2024
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Effect of closure of the Plasmodesmata between the central cell and the egg cell on DNA methylation in the egg cell
金子澪, 八代惇, 鎌田千裕, 長谷川綾子, 須崎大地, 杉直也, 殿崎薫, 丸山大輔, 木下哲
育種学研究 26 2024
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Alterations in DNA methylation during rice endosperm development
上地真子, 殿崎薫, 小野明美, 木下哲
育種学研究 26 2024
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Brassica rapaエピジェネティック変異体におけるDNAメチル化レベルの低下と生育への影響
神矢良樹, 奥崎文子, 殿崎薫, 肥塚信也, 藤本龍
園芸学研究 別冊 23 ( 1 ) 2024
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Effect of loci related to below-ground tuber pigmentation in the turnip cv. ‘Akamaru’ on the phenotype of progeny crossed with non-pigmented below-ground turnip
瀬川天太, 宮木海征, 殿崎薫, 熊澤利輝, 原蒔士, 齊賀空知, 高田茉莉奈, 高木宏樹
育種学研究 26 2024
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Development of a DNA maker related to anthocyanin less in broccoli florets
足立拓海, 岡本春菜, 白戸陽子, 殿崎薫, 清水元樹, 畠山勝徳
育種学研究 25 2023
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Functional analysis of Fe-S biogenesis gene in the endosperm development of rice
矢口杏珠, 丸岡博, 小野明美, 殿崎薫, 遠藤真咲, 木下哲, 矢口杏珠, 丸岡博, 殿崎薫, 遠藤真咲, 木下哲, 遠藤真咲, 遠藤真咲
育種学研究 25 2023
-
Comparing two methods of WGBS and EM-seq~DNA methylation analysis in rice endosperm~
上地真子, 浅井一希, 殿崎薫, 小野明美, 木下哲
育種学研究 25 2023
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Silencing mechanism by canonical and non-canonical RdDM pathway in egg cell
八代惇, 鎌田千裕, 長谷川綾子, 金子澪, 須崎大地, 杉直也, 殿崎薫, 丸山大輔, 木下哲
育種学研究 24 2022
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Functional characterization of a NLR gene in the clubroot resistant locus Crr3 in Brassica rapa
FANGQI Shen, 清水元樹, 高橋美紗子, 殿崎薫, 松元哲, 久保中央, 畠山勝徳
育種学研究 24 2022
-
Identification of a paternally imprinted gene regulating endosperm development and seed size control
和田七夕子, 山口翔, 下保瑶己, 保坂碧, 山口京, 山田慧士朗, 海老原諒子, 肥後あすか, 殿崎薫, 辻寛之, 高山誠司, 木下哲, 伊藤寿朗
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022
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Multi layers of epigenetic controls in the genomic imprinting during rice endosperm development
殿崎薫, 木下哲
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022
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Exploration of commercial radish cultivars for genetic transformation
尾形圭介, 殿崎薫, 畠山勝徳
育種学研究 23 2021
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Genome wide association study for traits of edible pod in pea
佐々木祥子, 白澤健太, 殿崎薫, 高畑義人, 畠山勝徳
育種学研究 23 2021
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Transcription and transcriptional regulation of MERMITE18B transposon subfamily in rice endosperm
永田博基, 小野明美, 殿崎薫, 殿崎薫, 川勝泰二, 木下哲
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021
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Hypersensitive response induced by stacking of two candidate ORFs of clubroot resistant locus Crr1b in Arabidopsis thaliana
秋田谷茉那, 清水元樹, 高橋美紗子, 松元哲, 殿崎薫, 畠山勝徳
育種学研究 23 2021
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Identification of PRC2 targets in rice endosperm
殿崎薫, 小野明美, 古海弘康, 野々村賢一, 佐藤豊, 遠藤真咲, COMAI Luca, 畠山勝徳, 川勝泰二, 木下哲
育種学研究 23 2021
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Comparison of the imprintome between cultivated rice and wild rice
殿崎薫, 殿崎薫, 殿崎薫, 小野明美, 永田博基, 古海弘康, 野々村賢一, 川勝泰二, 佐藤豊, COMAI Luca, 木下哲
育種学研究 22 2020
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Genetic analysis of edible pod characters in pea
佐々木祥子, 白澤健太, 殿崎薫, 高畑義人, 畠山勝徳
育種学研究 22 2020
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お米(イネ胚乳)の生長を制御するOsEMF2a遺伝子
川勝泰二, 遠藤真咲, 木下哲, 殿崎薫, 小野明美, 国定愛美, 西野愛, 永田博基, 坂本真吾, 貴嶋紗久, 古海弘康, 野々村賢一, 佐藤豊, 高木優, 畠山勝徳
農研機構生物機能利用研究部門成果情報(Web) 2020 2020
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自律的胚乳発生を示すOsEMF2aの形態学的解析
国定愛美, 殿崎薫, 西野愛, 小野明美, 木下哲
育種学研究 21 2019
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イネ胚乳発生におけるOsEMF2aの機能解析
西野愛, 殿崎薫, 殿崎薫, 国定愛美, 小野明美, 木下哲
育種学研究 21 2019
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イネ種間雑種胚乳におけるインプリントーム解析
殿崎薫, 殿崎薫, 川勝泰二, 小野明美, 古海弘康, 野々村賢一, COMAI Luca, 木下哲
育種学研究 21 2019
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シロイヌナズナの雌性配偶体細胞におけるエピゲノム制御機構の解析
鎌田千裕, 長谷川綾子, 殿崎薫, 須崎大地, 丸山大輔, 木下哲
日本植物学会大会研究発表記録 83rd 2019
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Research on post-fertilization barriers in the context of plant breeding
Ishii Takayoshi, Okamoto Takashi, Tonosaki Kaoru, Nagaki Kiyotaka, Kinoshita Tetsu
Breeding Research 19 ( 1 ) 35 - 40 2017
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倍数性操作によるイネ胚乳の生殖的隔離の打破
TONOSAKI KAORU, SEKINE DAISUKE, ONISHI TAKAYUKI, FURUUMI HIROYASU, KURATA NORI, KINOSHITA TETSU
育種学研究 17 117 2015.3
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ダイコン高密度連鎖地図へのゲノム配列の配置
北柴大泰, LI F, 平川英樹, 川邊隆大, 殿崎薫, 白澤健太, 田畑哲之, 西尾剛
育種学研究 15 23 2013.10
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Brassica napusとの種間雑種形成能に関与するBrassica rapaのBrFIEa及びBrMIS1aの変異
殿崎薫, 殿崎薫, 北柴大泰, 金子幸雄, 西尾剛
育種学研究 15 2013
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Brassica rapaの属間雑種形成能QTL領域内に座乗する遺伝子の解析
殿崎薫, 北柴大泰, 金子幸雄, 西尾剛
育種学研究 15 2013
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Raphanus sativusとの属間交雑におけるBrassica rapaの雑種種子形成能の遺伝分析
殿崎薫, 北柴大泰, 金子幸雄, 西尾剛
育種学研究 14 2012
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アブラナ科遺伝資源とイネ科雑草の種判別技術の開発
殿崎薫, 堀佑太郎, 北柴大泰, 西尾剛
育種学研究 14 2012
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ストレプトアビジンコート磁気ビーズを用いたアリル特異的ハイブリダイゼーション法によるSNP分析技術の開発
殿崎薫, 工藤純平, 北柴大泰, 西尾剛
育種学研究 14 2012
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種特異的SNPマーカーによるBrassica rapa一染色体添加ダイコン系統の添加染色体の同定
殿崎薫, 西尾剛, 赤羽美智子, BANG S. W., 金子幸雄
育種学研究 13 2011
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EST-based SNPマーカーによるダイコン高密度連鎖地図とゲノム解析への利用
北柴大泰, LI F., ZOU Zhongwei, 殿崎薫, 西尾剛
育種学研究 13 2011
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Raphanus sativusとBrassica rapaの根肥大性に関するQTLのシンテニー解析
殿崎薫, LI F., 北柴大泰, 西尾剛
育種学研究 13 2011
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Brassica rapaとRaphanus sativusの属間交雑における雑種胚崩壊性のQTL解析
殿崎薫, 道場和也, 北柴大泰, BANG S., 金子幸雄, 西尾剛
育種学研究 12 2010
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種特異的ITS1プローブを用いた簡易種判別技術の開発
殿崎薫, 西尾剛
育種学研究 12 2010
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Brassica rapa×Raphanus sativusから得たF<sub>1</sub>雑種集団の種子稔性
道場和也, 殿崎薫, BANG S., 金子幸雄
育種学研究 11 2009
Presentations
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イネの胚乳発生過程におけるゲノムインプリンティングの多層的なエピゲノム制御
殿崎薫, 木下哲
第45回日本分子生物学会年会 2022.12
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イネ胚乳発生を制御するポリコーム複合体の標的遺伝子の同定
殿崎薫, 小野明美, 古海弘康, 野々村賢一, 佐藤豊, 遠藤真咲, Luca Comai, 畠山勝徳, 川勝泰二, 木下哲
日本育種学会第139回講演会 2021.3
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The factor of transcriptional repression regulating endosperm development in rice
2021.3
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イネ種間雑種胚乳におけるインプリントーム解析
殿崎 薫, 川勝 泰二, 小野 明美, 古海 弘康, 野々村 賢一, Luca Comai, 木下 哲
日本育種学会第136回講演会 2020.3
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Overcoming interspecific hybridization barrier in rice endosperm by ploidy manipulation International conference
K. Tonosaki, D. Sekine, T. Ohonishi, H. Furuumi, N. Kurata, T. Kinoshita
24th International congress on sexual plant reproduction 2016.3
-
Multi-layers of epigenetic controls in the genomic imprinting during rice endosperm development
Kaoru Tonosaki, Akemi Ono, Hiroyasu Furuumi, Yutaka Sato, Taiji Kawakatsu, Tetsu Kinoshita
CSHA Integrative Epigenetics in Plants 2022.12
-
倍数性操作によるイネ胚乳の生殖的隔離の打破
殿﨑薫, 関根大輔, 大西孝幸, 古海弘泰, 倉田のり, 木下哲
日本育種学会第127回講演会 2015.3
-
イネ胚乳の生殖的隔離の理解とその打破
殿崎 薫, 黒坂 絵美, 古海 弘康, 佐藤 豊, 畠山 勝徳, 木下 哲
イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2023 2023.7
-
H3K27me3レベル改変による Oryza sativa × O. australiensis の雑種胚乳における生殖的隔離の打破
黒坂 絵美, 中山 怜南, 古海 弘康, 佐藤 豊, 木下 哲, 畠山 勝徳, 殿崎 薫
日本育種学会第144回講演会 2023.9
-
エンドウにおける莢可食性関連形質の遺伝解析
佐々木祥子, 白澤健太, 殿崎薫, 高畑義人, 畠山勝徳
日本育種学会第136回講演会 2020.3
-
アブラナ科遺伝資源とイネ科雑草の種判別技術の開発
殿崎薫, 堀裕太郎, 北柴大泰, 西尾剛
日本育種学会第121回講演会 2012.3
-
ストレプトアビジンコート磁気ビーズを用いたアリル特異的ハイブリダイゼーション法によるSNP分析技術の開発
殿崎薫, 工藤純平, 北柴大泰, 西尾剛
日本育種学会第121回講演会 2012.3
-
Raphanus sativusとの属間交雑におけるBrassica rapaの雑種種子形成能の遺伝分析
殿崎薫, 北柴大泰, 金子幸雄, 西尾剛
日本育種学会第122回講演会 2012.9
-
種特異的SNPマーカーによるBrassica rapa一染色体添加ダイコン系統の添加染色体の同定
殿崎薫, 西尾剛, 赤羽美智子, 房相佑, 金子幸雄
日本育種学会第119回公演会 2011.3
-
Brassica rapaにおける胚軸肥大性のQTL解析
殿崎薫, 道場和也, 北柴大泰, 房相佑, 金子幸雄, 西尾剛
第５回東北育種研究集会 2010.8
-
Comparative analysis of QTL for root thickness between Brassica rapa and Raphanus sativus International conference
K. Tonosaki, H. Kitashiba, Y. Kaneko, T. Nishio
Plant & Animal Genome XX. 2012.1
-
Raphanus sativusとBrassica rapaの根肥大性に関するQTLのシンテニー解析
殿崎薫, 李峰, 北柴大泰, 西尾剛
日本育種学会第120回講演会 2011.9
-
Brassica rapaとRaphanus sativusの属間交雑における雑種胚崩壊性のQTL解析
殿崎薫, 道場和也, 北柴大泰, 房相佑, 金子幸雄, 西尾剛
日本育種学会第117回講演会 2010.3
-
B. rapa × R. sativusにおける高度雑種形成能素材の開発
殿崎薫, 道場和也, 房相佑, 金子幸雄, 松澤康男
日本育種学会第115回講演会 2009.3
-
シロイヌナズナの雌性配偶体細胞におけるエピゲノム制御機構の解析
鎌田千裕, 長谷川綾子, 殿崎薫, 須崎大地, 丸山大輔, 木下哲
日本植物学会第83回大会 2019.9
-
自律的胚乳発生を示すOsEMF2aの形態学的解析
国定愛美, 殿崎薫, 西野愛, 小野明美, 木下哲
日本育種学会第136回講演会 2019.9
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イネ胚乳発生におけるOsEMF2aの機能解析
西野愛, 殿崎薫, 国定愛美, 小野明美, 木下哲
日本育種学会第135回講演会 2019.3
-
’聖護院大根’の分離集団から見出された自家和合性系統の原因調査
菅野翔太, 殿崎薫, 北柴大泰, 西尾剛
第10回東北育種研究集会 2015.11
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Brassica napusとの雑種形成能における Brassica rapaのBrFIEaおよびBrMSI1a遺伝子の遺伝的効果の検証
宮腰 開, 齊藤光太郎, 殿崎薫, 北柴大泰, 西尾剛
第12回東北育種研究集会 2017.11
-
Brassica rapaの属間雑種形成能QTL領域内に座乗する遺伝子の解析
殿崎薫, 北柴大泰, 金子幸雄, 西尾剛
日本育種学会第123回講演会 2013.3
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Epistatic effect between two QTL enhances hybrid seed formation ability of Brassica rapa in intergeneric hybridization with Raphanus sativus International conference
Tonosaki K, Kitashiba H, Kaneko Y, Nishio T
Comparative Genomics and Breeding of Brassicaceae Crops 2012.10
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胚乳における生殖的隔離因子の探索
木下哲, 殿崎薫
第56回日本植物生理学会 2015.1
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Brassica napusとの雑種形成能に関与するBrassica rapaのBrFIEa及びBrMSI1aの変異
殿崎薫, 北柴大泰, 金子幸雄, 西尾剛
日本育種学会第124回講演会 2013.10
-
Genetic and Epigenetic Regulation of Vernalization Response via Chromosome Substitution in the genus Brassica
Chowdhury Akhi Paul, Shuta Yano, Kaoru Tonasaki, Ryo Fujimoto
Cold Spring Harbor Asia, Plant Reproductive Development and Genomics 2025.5
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Functional analysis of OsEMF2a in rice endosperm development
Megumi Nishino, Kaoru Tonosaki, Megumi Kunisada, Akemi Ono, Tetsu Kinoshita
2019.11
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イネ胚乳における雄性インプリント遺伝子の多層的な制御
殿崎薫, 木下哲
日本遺伝学会第９６回大会 2024.9
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ブロッコリー花蕾のアントシアニンレス形質を選 抜する DNA マーカーの開発
足立 拓海, 岡本 春菜, 白戸 陽子, 殿崎 薫, 清水 元樹, 畠山 勝徳
日本育種学会第144回講演会 2023.9
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単為発生および自律的な胚乳発生を示すイネ PRC2 二重変異体の解析
殿崎 薫, 木下 哲
日本育種学会第144回講演会 2023.9
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Brassica rapa エピジェネティック変異体におけるDNAメチル化レベルの低下と生育への影響
神矢良樹, 奥崎文子, 殿崎薫, 肥塚信也, 藤本龍
令和5年度園芸学会近畿支部大会 2023.9
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野生イネの育種利用に向けた生殖的隔離メカニズムの理解 Invited
殿崎薫
日本育種学会 第146回講演会ワークショップ 2024.9
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ハクサイ根こぶ病抵抗性遺伝子座Crr1b上の2つのNLR遺伝子を集積したコマツナの根こぶ病抵抗性
畠山勝徳, 塚崎素子, 秋田谷茉那, 高橋美佐子, 殿崎薫, 清水元樹, 松元哲
日本育種学会 第146回講演会 2024.9
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Study on Candidate Flowering-Related QTL in Extremely Late flowering Brassica rapa Identified by QTL-Sequencing
2025.1
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アブラナ科野菜の花成誘導に関する新規育種システム基盤の構築 Invited
殿崎薫
令和６年度 次世代品種開発セミナー 2024.12
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Single-nucleus RNA-sequencingに向けたオオムギ茎頂の核単離の条件検討
武田良太, 井藤純, 野村有子, 佐藤奈緒, 廣田敦子, 林誠, 久野裕, 内野智樹, 那須田周平, 殿崎薫, 木下哲, 鹿島誠, 辻寛之
第19回 ムギ類研究会 2024.12
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アブラナ科植物の晩抽性育種に向けた研究展開 Invited
殿崎薫
第4 回アブラナ科ゲノム育種研究会 2024.10
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植物の種間交雑で見られるオス・メスゲノムのコンフリクト Invited
殿崎薫, 木下哲
第47回日本分子生物学会シンポジウム 2024.11
Awards
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YCU Frontier Research Fellow
2025.1
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奨励賞
2024.3 日本育種学会
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優秀発表賞
2023.9 日本育種学会 第144回講演会
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優秀発表賞
2021.3 日本育種学会 第139回講演会
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優秀発表賞
2019.9 第２回植物インフォマティクス研究会
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優秀発表賞
2019.9 日本育種学会 第136回講演会
Research Projects
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生殖様式の変化が駆動するゲノムインプリンティングの進化原理
Grant number：25H01827 2025.4 - 2027.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A)
殿崎 薫
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\11180000 （ Direct Cost: \8600000 、 Indirect Cost：\2580000 ）
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2024.10 - 2032.3
JST 創発的研究支援事業
殿崎 薫
Authorship：Principal investigator
野生種は環境ストレスや病害虫に強い優れたな遺伝資源であり、気候変動やニーズの多様化などの広範な育種需要への活用が期待できます。しかし、異なる種間での交配は、隔離障壁という現象により妨げられるため、利用できる種は限定的です。本研究では、エピゲノムに着目したオミクス解析から、胚乳の隔離障壁機構の謎を解明します。そして、汎用的な隔離障壁の打破技術を開発し、幅広い種間での品種開発の実現を目指します。
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アブラナ科野菜の花成誘導に関する新規育種システム基盤の構築
2024.10 - 2027.3
生研センター オープンイノベーション研究・実用化推進事業
殿崎 薫, 本城 正憲, 日浦 聡子, 吉田 モモ, 藤本 龍, 高木 宏樹, 濱本 亮, 西川 和裕、森玉 陽介
Authorship：Principal investigator
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Exploring the mechanisms behind asexual embryo formation and autonomous endosperm in PRC2 mutants
Grant number：24K08850 2024.4 - 2027.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Grant amount：\4550000 （ Direct Cost: \3500000 、 Indirect Cost：\1050000 ）
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カブ (Brassica rapa) における光『非』依存的なアントシアニン蓄積機構の解明
Grant number：23K05170 2023.4 - 2026.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
高木 宏樹, 西内 巧, 殿崎 薫, 伊藤 秀臣
Grant amount：\4680000 （ Direct Cost: \3600000 、 Indirect Cost：\1080000 ）
Brassica rapa に属するカブ品種「アカマル」は、光非依存的なアントシアニン蓄積 (LIA: Light Independent Anthocyanin) 機構を有し、地上部および地下部の両方においてアントシアニン系色素を蓄積する。これまでに、アカマルおよび非 LIA タイプのカブ品種「金沢青カブ」間の交雑後代における遺伝解析から、「アカマル」由来の劣性 LIA 原因遺伝子領域 qLIA7-A (染色体 A07:29.20-36.35 Mb) が同定された。本研究では、LIA 機構における qLIA7-A の機能解明を目的として、まず、「金沢青カブ」遺伝背景に qLIA7-A を導入した「NIL496」を育成した。「NIL496」は、地上部のみが着色し、LIA を示さず、qLIA7-A の効果は確認されなかった。しかし、「アカマル」および 「NIL496」 間の交雑 F1 世代は LIA を示し、LIA の発揮には、qLIA7-A のホモ接合性遺伝子型およびアカマル由来の優性遺伝子が必要であることが示唆された。一方、非 LIA タイプのカブ品種「日野菜」由来の qLIA7 (qLIA7-H) をアカマル遺伝背景に導入した「NIL11」を育成した。「NIL11」の個体間では、同質ゲノムを有するにも関わらず、LIA 表現型が分離し、LIA にはエピジェネティックな制御機構の関与が推察された。さらに、発現解析およびメチローム解析を行なった結果、LIA を示す個体の地下部では、アントシアニン生合成経路における正の転写因子 BrMyb2 が発現しており、第３エキソン由来 siRNA の発現および第２-３エキソン領域の高度 DNA メチル化が確認された。以上より、LIA 機構には、BrMyb2 におけるエピジェネティック修飾の関与が示唆された。
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Verification of epigenetic abnormalities in hybrid endosperm and estimation of its mechanism
Grant number：20K15504 2020.4 - 2023.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Early-Career Scientists Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Tonosaki Kaoru
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\4290000 （ Direct Cost: \3300000 、 Indirect Cost：\990000 ）
The interspecific crossing between cultivated rice and wild rice shows lethal phenotypes in hybrid seeds due to the hybrid endosperm abnormality. Our study revealed that almost paternally imprinted genes were de-repressed in the hybrid endosperm. We also revealed a repressive histone mark, H3K27me3, controls the mono-allelic expression pattern of paternally imprinted genes in rice endosperm. In addition, we succussed in overcoming the hybridization barrier using mutant rice of OsEMF2a involved in catalytic H3K27me3. These results show that H3K27me3 involves the hybridization barrier in rice endosperm.
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Mechanisms of endosperm development controlled by Polycomb repressive complex 2 in rice
Grant number：17K15210 2017.4 - 2020.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B) Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Tonosaki Kaoru
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\4290000 （ Direct Cost: \3300000 、 Indirect Cost：\990000 ）
In this study, we demonstrate that mutation of the rice gene OsEMF2a, which encodes a component of PRC2, causes an abnormally delayed developmental transition in the endosperm. In addition, transcriptome and H3K27me3 ChIP-seq analyses in Osemf2a mutant identified the putative downstream targets of PRC2, that are required for endosperm development. Before fertilization, we observed an autonomous endosperm phenotype in Osemf2a mutant, even in the absence of fertilization. Detailed histological and transcriptomic analyses revealed that the autonomous endosperm can produce storage compounds, starch granules and protein bodies specific to the endosperm.
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Elucidation of the mechanism of interspecific barrier during endosperm development in rice
Grant number：16J02580 2016.4 - 2019.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for JSPS Fellows Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\4420000 （ Direct Cost: \3400000 、 Indirect Cost：\1020000 ）
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Ｂｒａｓｓｉｃａ ｒａｐａにおける生殖的隔離遺伝子の同定
Grant number：13J02584 2013.4 - 2015.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 特別研究員奨励費
殿﨑 薫
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2300000 （ Direct Cost: \2000000 、 Indirect Cost：\300000 ）
種間交雑では，しばしば胚乳発生異常など種子形成時の生殖的隔離が障害となる．ハクサイやカブ等を含むBrassica rapaとダイコンを含むRaphsnus sativusの種間交雑では，胚乳発生の異常が生じる．しかしながら，B. rapa品種の「聖護院カブ」を種子親として用い，R. sativusの花粉を交雑した場合には，例外的に低頻度ながらも種間の生殖的隔離が打破される．これまでに，雑種形成能力を有する「聖護院カブ」と雑種形成能力のない「チーフハクサイ」を用いた遺伝解析から、B. rapaの雑種形成能に関わる３つのQTLを同定し，その内、２つのQTL領域内に座乗するBrFIE及びBrMSI1の２つの遺伝子において，機能に影響を及ぼすと推定されるフレームシフト変異を見出している．
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BrFIEおよびBrMSI1は，ポリコーム複合体構成因子をコードしている．ポリコーム複合体は、MADS-box転写因子であるPHE1やAGL62の発現を抑制することで正常な胚乳発生を制御している．そこで，B. rapaのポリコーム複合体標的遺伝子と推定されるBrPHE1及びBrAGL62について，自殖種子及びR. sativusとの雑種種子での発現解析を行った．自殖・雑種種子に関わらず「聖護院カブ」由来のゲノムを持つ場合，標的遺伝子の発現レベルは「チーフハクサイ」のそれらより低い傾向にあった．このことから「聖護院カブ」では，恒常的にポリコーム複合体による標的遺伝子の制御が強く，それによって種間交雑でも胚乳発生に関わる遺伝子を正常に制御することができているため，生殖的隔離を打破している可能性が考えられた．
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ナチュラルバリエーションの中から，生殖的隔離を引き起こす因子としてポリコーム複合体の関与を示したのは初めての結果である．ポリコーム複合体の種内変異の重要性を示した例はこれまでになく，本研究成果から種間交雑で見られる生殖的隔離の分子機構に関与する重要な知見を得ることができた．
Teaching Experience
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生命科学実験
2025.10 Institution：Yokohama City University
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生物機能実習
2024.4 Institution：Yokohama City University
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植物育種学
2023.10 - 2024.2 Institution：Tamagawa University
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遺伝学
2023.7 Institution：Yokohama City University
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生命機能実習Ⅲ
2023.4 Institution：Yokohama City University
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生命機能計測実験
2023.4 Institution：Yokohama City University
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先端科学演習a
2022.10 Institution：Yokohama City University
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先端科学実習a
2022.10 Institution：Yokohama City University
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基礎生物学実験
2022.10 - 2023.2 Institution：Yokohama City University
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自然科学基礎実験C
2022.10 - 2023.2 Institution：Yokohama City University
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ゲノム遺伝学
2022.7 - 2023.7 Institution：Yokohama City University
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Advanced Next Generation Agricultural Studies
2021.4 - 2021.8 Institution：Iwate University
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Exercises in Plant Life Science 1
2020.10 - 2022.3 Institution：Iwate University
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Advanced Plant Molecular Genetics
2020.10 - 2022.1 Institution：Iwate University
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Basic Seminar (For first-year students)
2020.4 - 2021.8 Institution：Iwate University
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Exercises in Plant Life Science 2
2020.4 - 2021.8 Institution：Iwate University
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Plant Breeding Laboratory
2020.4 - 2021.8 Institution：Iwate University
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Introduction to Agricultural Science
2020.4 - 2021.8 Institution：Iwate University
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Genetic Breeding
2020.4 - 2021.8 Institution：Iwate University
Social Activities
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市民公開講座「植物の生殖過程で見られる種の障壁」
Role(s)： Lecturer
木原生物学研究所 2022.8
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出前講義・栃木県立足利高等学校
Role(s)： Lecturer
岩手大学 2021.11
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出前講義・岩手県立盛岡第四高等学校
Role(s)： Lecturer
岩手大学 2021.10
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実験講座「データサイエンスで紐解く遺伝子の変化」
Role(s)： Lecturer, Advisor, Organizing member
岩手大学 2021.7
Media Coverage
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ゲノム刷り込みの多層的な制御機構の解明 横浜市立大など研究グループ Internet
農業共同組合新聞 2024.8
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（農研機構ほか）なぜこれだけ多くの仕組みが必要なのか～ゲノム刷り込みの多層的な制御機構の解明～ Internet
みんなの農業広場 提供：（一社）全国農業改良普及支援協会 ・（株）クボタ 2024.8
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横浜市大・農研機構・国立遺伝学研・理研・岩手大など、ゲノム刷り込みの多層的な制御機構を解明 Internet
日本経済新聞 2024.7
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なぜこれだけ多くの仕組みが必要なのか？ 〜ゲノム刷り込みの多層的な制御機構の解明〜 Internet
横浜市立大学プレスリリース 2024.7
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なぜこれだけ多くの仕組みが必要なのか？〜ゲノム刷り込みの多層的な制御機構の解明〜 Internet
沖縄タイムス 2024.7
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横浜市立大、受精せず種子形成するイネ開発 作物の育種年限短縮 Internet
日刊工業新聞 2023.9
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ガンダイニング２０２１ TV or radio program
IBCテレビ 2021.11
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お米（イネ胚乳）の生長を制御する遺伝子を同定 〜受粉無しでデンプンを蓄積〜 Internet
横浜市立大学プレスリリース 2020.11
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横浜市大・国立遺伝研・埼玉大・岩手大・農研機構、お米（イネ胚乳）の生長を制御する遺伝子を同定することに成功 Internet
日本経済新聞 2020.11
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栽培イネと野生イネ 種の障壁打破に成功 発芽可能な種子獲得 Newspaper, magazine
科学新聞 2018.1
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異なる種間の交雑において発芽可能な種子を得ることに成功－木原 均、西山市三博士が提唱した極核活性化説を実証－ Internet
横浜市立大学プレスリリース 2017.12
Academic Activities
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日本育種学会 第146回講演会（広島大学）
Role(s)： Panel moderator, session chair, etc.
2024.9
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日本育種学会 第144回講演会（神戸大学）
Role(s)： Panel moderator, session chair, etc.
2023.9
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Review Editor, Frontiers in Plant Science
Role(s)： Peer review
2021.4
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日本育種学会 第139回講演会（オンライン）
Role(s)： Panel moderator, session chair, etc.
2021.3
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文部科学省科学技術・学術政策研究所 専門調査員
Role(s)： Planning/Implementing academic research
2020.4 - 2021.3