Updated on 2026/09/28
Doctor of Philosophy ( 1999.3 Osaka University )
核磁気共鳴
nuclear magnetic resonance
3D-structure
蛋白質へのリガンド結合の協同性
蛋白質構造のアロステリック効果
NMR
protein
NMR
蛋白質の非特異的凝集
蛋白質の立体構造解析
Life Science / Structural biochemistry
Life Science / Biophysics
Osaka University
1994.4 - 1996.3
Country： Japan
Osaka University School of Science
1987.4 - 1991.3
Country： Japan
Niigata University Faculty of Agriculture
2022.4 - 2023.3
University of Tsukuba
2020.11 - 2021.3
Yokohama City University Professor
2014.4
Niigata University
2012.6 - 2013.3
Kyoto University Institute of Advanced Energy
2012.4 - 2013.3
Hiroshima University Faculty of Applied Biological Science
2009.4 - 2010.3
Hokkaido University School of Science
2005.6
Osaka University Institute for Protein Research
2002.3 - 2014.3
Max-Planck Institute in Goettingen Prof. C. Griesinger's group JSPS Postdoctoral Fellowship
2001.10 - 2002.3
マックスプランク研究所 生物物理化学（ゲッティンゲン） 日本学術振興会海外特別研究員
2001.10 - 2002.3
Frankfurt University Prof. C. Griesinger's group JSPS Postdoctoral Fellowship
2000.11 - 2001.9
フランクフルト大学 有機化学研究所 日本学術振興会海外特別研究員
2000.11 - 2001.9
Nara Institute of Science and Technology Graduate School of Biological Sciences Research Associate
1997.4 - 2002.3
Nara Institute of Science and Technology Graduate School of Biological Sciences
1996.4 - 1997.3
Hitachi, Ltd. Engineer of electron microscopy
1991.4 - 1994.3
日立製作所 計測器事業部 電子顕微鏡のソフトウェア開発
1991.4 - 1994.3
日本核磁気共鳴学会
横浜市立大学理学部 副理学部長
2026.4
京都大学 エネルギー理工学研究所 共同利用運営委員会副委員長
2023.4
Committee type：Academic society
日本核磁気共鳴学会 機関誌編集委員
2022.4
Committee type：Academic society
ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST2021 合同会議 プログラム委員会委員・総務委員会委員
2021.3 - 2021.12
Committee type：Academic society
The Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan President
2020.4 - 2022.3
Committee type：Academic society
日本核磁気共鳴学会 機関誌編集委員長
2018.4 - 2020.3
Committee type：Academic society
日本核磁気共鳴学会 副学会長
2018.4 - 2020.3
Committee type：Academic society
大阪大学蛋白質研究所 専門委員会委員
2017.4 - 2019.3
Committee type：Academic society
京都大学 エネルギー理工学研究所 共同利用・共同研究計画委員副委員長
2014.4 - 2023.3
Committee type：Academic society
大阪大学蛋白質研究所 超高磁場NMR共同利用・共同研究専門部会委員
2014.4 - 2016.3
Committee type：Academic society
第27回 生体系磁気共鳴国際会議 ICMRBS 組織委員・実行委員幹事
2013.8 - 2016.12
Committee type：Academic society
日本核磁気共鳴学会 理事
2012.4 - 2022.3
Committee type：Academic society
日本核磁気共鳴学会 機関誌編集副委員長
2012.4 - 2018.3
Committee type：Academic society
日本生物物理学会 会誌編集委員
2012.4 - 2014.3
Committee type：Academic society
京都大学 エネルギー理工学研究所 共同利用・共同研究計画委員
2011.4 - 2014.3
Committee type：Academic society
日本核磁気共鳴学会 評議員
2008.4 - 2022.3
Committee type：Academic society
日本生化学会 近畿支部幹事
2005.4 - 2013.3
Committee type：Academic society
日本生物物理学会 学会員
2003.4 - 2021.7
日本核磁気共鳴学会 学会員
2003
Structural and Biophysical Basis of Circadian Output Kinase SasA and Its Discrete Stoichiometric Assembly With the KaiC Hexamer
Sota W. Suzuki, Yuki Hirato, Takahiro Iida, Takahisa Ikegami, Masaru Goto, Risa Mutoh
Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 2026.9
Freezing-Induced Modulation of Molecular Motion and Self-Assembly in the Water/Dimethyl Sulfoxide/Polyoxyethylene (20) Oleyl Ether Micellar Solution System Reviewed
Makoto Uyama, Hirohmi Watanabe, Takahisa Ikegami
The Journal of Physical Chemistry B 130 ( 36 ) 9236 - 9244 2026.9
Makoto Uyama, Yuki Umino, Fumio Matsuda, Ayako Furukawa, Kenji Sugase, Takahisa Ikegami
Analytical Chemistry 97 ( 41 ) 22624 - 22631 2025.10
Himari Suzuki, Yuki Nicole Makiyama, Yuta Watanabe, Hideo Akutsu, Michiko Tajiri, Yoko Motoda, Ken-Ichi Akagi, Tsuyoshi Konuma, Satoko Akashi, Takahisa Ikegami
Biochemistry 64 ( 9 ) 1916 - 1932 2025.4
Revealing an origin of temperature-dependent structural change in intrinsically disordered proteins Reviewed
Rintaro Inoue, Takashi Oda, Hiroshi Nakagawa, Taiki Tominaga, Takahisa Ikegami, Tsuyoshi Konuma, Hiroki Iwase, Yukinobu Kawakita, Mamoru Sato, Masaaki Sugiyama
Biophysical Journal 2024.12
Tsuyoshi Konuma, Tomoyo Takai, Chieko Tsuchiya, Masayuki Nishida, Miyu Hashiba, Yudai Yamada, Haruka Shirai, Yoko Motoda, Aritaka Nagadoi, Eriko Chikaishi, Ken‐ichi Akagi, Satoko Akashi, Toshio Yamazaki, Hideo Akutsu, Takahisa Ikegami
Protein Science 33 ( 6 ) 2024.5
Biophysical insights into the dimer formation of human Sirtuin 2 Reviewed
Noa Suzuki, Tsuyoshi Konuma, Takahisa Ikegami, Satoko Akashi
Protein Science 2024.5
Sayaka Hokazono, Eri Imagawa, Daishi Hirano, Takahisa Ikegami, Kimihiko Oishi, Tsuyoshi Konuma
Biomolecular NMR Assignments 2024.3
Interaction modes of human orexin 2 receptor with selective and nonselective antagonists studied by NMR spectroscopy Reviewed
Kayo Imamura, Ken-Ichi Akagi, Yohei Miyanoiri, Hirokazu Tsujimoto, Takatsugu Hirokawa, Hideo Ashida, Kaori Murakami, Asuka Inoue, Ryoji Suno, Takahisa Ikegami, Naotaka Sekiyama, So Iwata, Takuya Kobayashi, Hidehito Tochio
Structure 2024.1
GAS41 promotes H2A.Z deposition through recognition of the N terminus of histone H3 by the YEATS domain. Reviewed International journal
Masaki Kikuchi, Shohei Takase, Tsuyoshi Konuma, Kota Noritsugu, Saaya Sekine, Takahisa Ikegami, Akihiro Ito, Takashi Umehara
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120 ( 43 ) e2304103120 2023.10
CPMG pulse sequence for relaxation dispersion that cancels artifacts independently of spin states. Reviewed International journal
Tsuyoshi Konuma, Jun-Ichi Kurita, Takahisa Ikegami
Journal of magnetic resonance 352 107489 - 107489 2023.5
Structural basis for the unique multifaceted interaction of DPPA3 with the UHRF1 PHD finger. Reviewed International journal
Keiichi Hata, Naohiro Kobayashi, Keita Sugimura, Weihua Qin, Deis Haxholli, Yoshie Chiba, Sae Yoshimi, Gosuke Hayashi, Hiroki Onoda, Takahisa Ikegami, Christopher B Mulholland, Atsuya Nishiyama, Makoto Nakanishi, Heinrich Leonhardt, Tsuyoshi Konuma, Kyohei Arita
Nucleic acids research 50 ( 21 ) 12527 - 12542 2022.11
Crystal structure of higher plant heme oxygenase-1 and its mechanism of interaction with ferredoxin Reviewed
Rei Tohda, Hideaki Tanaka, Risa Mutoh, Xuhong Zhang, Young-Ho Lee, Tsuyoshi Konuma, Takahisa Ikegami, Catharina T. Migita, Genji Kurisu
Journal of Biological Chemistry 296 100217 - 100217 2021.1
Sensitivity enhancement by sequential data acquisition for 13C-direct detection NMR. Reviewed International journal
Kyoko Furuita, Toshihiko Sugiki, Mika Takamuku, Yoshikazu Hattori, Masatomo So, Yasushi Kawata, Takahisa Ikegami, Toshimichi Fujiwara, Chojiro Kojima
Journal of magnetic resonance (San Diego, Calif. : 1997) 322 106878 - 106878 2021.1
The structure of SeviL, a GM1b/asialo-GM1 binding R-type lectin from the mussel Mytilisepta virgata. Reviewed International journal
Kenichi Kamata, Kenji Mizutani, Katsuya Takahashi, Roberta Marchetti, Alba Silipo, Christine Addy, Sam-Yong Park, Yuki Fujii, Hideaki Fujita, Tsuyoshi Konuma, Takahisa Ikegami, Yasuhiro Ozeki, Jeremy R H Tame
Scientific reports 10 ( 1 ) 22102 - 22102 2020.12
Screening of protein-ligand interactions under crude conditions by native mass spectrometry Reviewed
Kotaro Takano, Shunsuke Arai, Seiji Sakamoto, Hiroshi Ushijima, Takahisa Ikegami, Kazumi Saikusa, Tsuyoshi Konuma, Itaru Hamachi, Satoko Akashi
Analytical and Bioanalytical Chemistry 412 ( 17 ) 4037 - 4043 2020.7
Calcium sensing via EF-hand 4 enables thioredoxin activity in the sensor-responder protein calredoxin in the green alga Chlamydomonas reinhardtii Reviewed
Ratana Charoenwattanasatien, Karen Zinzius, Martin Scholz, Susann Wicke, Hideaki Tanaka, Johann S. Brandenburg, Giulia M. Marchetti, Takahisa Ikegami, Takashi Matsumoto, Takashi Oda, Mamoru Sato, Michael Hippler, Genji Kurisu
Journal of Biological Chemistry 295 ( 1 ) 170 - 180 2020.1
Structural adaptations of photosynthetic complex I enable ferredoxin-dependent electron transfer. Reviewed
Schuller JM, Birrell JA, Tanaka H, Konuma T, Wulfhorst H, Cox N, Schuller SK, Thiemann J, Lubitz W, Sétif P, Ikegami T, Engel BD, Kurisu G, Nowaczyk MM
Science (New York, N.Y.) 363 ( 6424 ) 257 - 260 2018.12
Hidekazu Hiroaki, Kaori Satomura, Natsuko Goda, Yukako Nakakura, Minami Hiranuma, Takeshi Tenno, Daizo Hamada, Takahisa Ikegami
Molecules 23 ( 10 ) 2018.9
A novel chitin‐binding mode of the chitin‐binding domain of chitinase A1 from Bacillus circulans WL ‐12 revealed by solid‐state NMR Reviewed International journal
Hiroki Tanaka, Hideo Akutsu, Izumi Yabuta, Masashi Hara, Hayuki Sugimoto, Takahisa Ikegami, Takeshi Watanabe, Toshimichi Fujiwara
FEBS Letters 592 ( 18 ) 3173 - 3182 2018.9
Tsuyoshi Konuma, Aritaka Nagadoi, Jun-ichi Kurita, Takahisa Ikegami
Magnetochemistry 4 ( 3 ) 33 - 33 2018.7
X-ray structure of an asymmetrical trimeric ferredoxin-photosystem I complex. Reviewed
Kubota-Kawai H, Mutoh R, Shinmura K, Sétif P, Nowaczyk MM, Rögner M, Ikegami T, Tanaka H, Kurisu G
Nature plants 4 ( 4 ) 218 - 224 2018.4
Mosebach L, Heilmann C, Mutoh R, Gäbelein P, Steinbeck J, Happe T, Ikegami T, Hanke G, Kurisu G, Hippler M
Photosynthesis research 134 ( 3 ) 291 - 306 2017.6
Kim JY, Kinoshita M, Kume S, Gt H, Sugiki T, Ladbury JE, Kojima C, Ikegami T, Kurisu G, Goto Y, Hase T, Lee YH
The Biochemical journal 473 ( 21 ) 3837 - 3854 2016.8
The cyanobacterial cytochrome b6f subunit PetP adopts an SH3 fold in solution. Reviewed
Veit S, Nagadoi A, Rögner M, Rexroth S, Stoll R, Ikegami T
Biochimica et biophysica acta 1857 ( 6 ) 705 - 714 2016.3
Korste A, Wulfhorst H, Ikegami T, Nowaczyk MM, Stoll R
Data in brief 6 249 - 252 2015.12
X-ray Structure and Nuclear Magnetic Resonance Analysis of the Interaction Sites of the Ga-Substituted Cyanobacterial Ferredoxin. Reviewed International journal
Mutoh R, Muraki N, Shinmura K, Kubota-Kawai H, Lee YH, Nowaczyk MM, Rögner M, Hase T, Ikegami T, Kurisu G
Biochemistry 54 ( 39 ) 6052 - 61 2015.9
Functional conformer of c-Myb DNA-binding domain revealed by variable temperature studies. Reviewed
Inaba S, Maeno A, Sakurai K, Narayanan SP, Ikegami T, Akasaka K, Oda M
The FEBS journal 282 ( 23 ) 4497 - 4514 2015.9
A Method for Systematic Assessment of Intrinsically Disordered Protein Regions by NMR. Reviewed
Goda N, Shimizu K, Kuwahara Y, Tenno T, Noguchi T, Ikegami T, Ota M, Hiroaki H
International journal of molecular sciences 16 ( 7 ) 15743 - 15760 2015.7
Kinoshita M, Kim JY, Kume S, Sakakibara Y, Sugiki T, Kojima C, Kurisu G, Ikegami T, Hase T, Kimata-Ariga Y, Lee YH
Biochimica et biophysica acta 1847 ( 10 ) 1200 - 1211 2015.6
Solution structure of the NDH-1 complex subunit CupS from Thermosynechococcus elongatus. Reviewed
Korste A, Wulfhorst H, Ikegami T, Nowaczyk MM, Stoll R
Biochimica et biophysica acta 1847 ( 10 ) 1212 - 1219 2015.5
The structure and conformational switching of Rap1B. Reviewed
Noguchi H, Ikegami T, Nagadoi A, Kamatari YO, Park SY, Tame JR, Unzai S
Biochemical and biophysical research communications 462 ( 1 ) 46 - 51 2015.4
Effects of a reduced disulfide bond on aggregation properties of the human IgG1 CH3 domain. Reviewed
Sakurai K, Nakahata R, Lee YH, Kardos J, Ikegami T, Goto Y
Biochimica et biophysica acta 1854 ( 10 ) 1526 - 1535 2015.3
Oktaviani NA, Risør MW, Lee YH, Megens RP, de Jong DH, Otten R, Scheek RM, Enghild JJ, Nielsen NC, Ikegami T, Mulder FA
Journal of biomolecular NMR 62 ( 2 ) 129 - 142 2015.3
Utilization of paramagnetic relaxation enhancements for high-resolution NMR structure determination of a soluble loop-rich protein with sparse NOE distance restraints Reviewed
Kyoko Furuita, Saori Kataoka, Toshihiko Sugiki, Yoshikazu Hattori, Naohiro Kobayashi, Takahisa Ikegami, Kazuhiro Shiozaki, Toshimichi Fujiwara, Chojiro Kojima
J. Biomol. NMR 61 ( 1 ) 55-64 2015.1
Investigation of Protein-Protein Interactions of Ferredoxin and Sulfite Reductase Under Different Sodium Chloride Concentrations by NMR Spectroscopy and Isothermal Titration Calorimetry Reviewed
Ju Yaen Kim, Takahisa Ikegami, Yuji Goto, Toshiharu Hase, Young-Ho Lee
MOLECULAR PHYSIOLOGY AND ECOPHYSIOLOGY OF SULFUR 169 - 177 2015
Furuita K, Kataoka S, Sugiki T, Hattori Y, Kobayashi N, Ikegami T, Shiozaki K, Fujiwara T, Kojima C
Journal of biomolecular NMR 61 ( 1 ) 55 - 64 2014.11
(1)H, (13)C and (15)N chemical shift assignments of the NDH-1 complex subunit CupS. Reviewed
Korste A, Wulfhorst H, Ikegami T, Nowaczyk MM, Stoll R
Biomolecular NMR assignments 9 ( 1 ) 169 - 171 2014.7
Mine S, Niiyama M, Hashimoto W, Ikegami T, Koma D, Ohmoto T, Fukuda Y, Inoue T, Abe Y, Ueda T, Morita J, Uegaki K, Nakamura T
The FEBS journal 281 ( 11 ) 2584 - 2596 2014.4
Ikenoue T, Lee YH, Kardos J, Yagi H, Ikegami T, Naiki H, Goto Y
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 111 ( 18 ) 6654 - 6659 2014.4
Akazawa-Ogawa Y, Takashima M, Lee YH, Ikegami T, Goto Y, Uegaki K, Hagihara Y
The Journal of biological chemistry 289 ( 22 ) 15666 - 15679 2014.4
Kataoka S, Furuita K, Hattori Y, Kobayashi N, Ikegami T, Shiozaki K, Fujiwara T, Kojima C
Biomolecular NMR assignments 9 ( 1 ) 89 - 92 2014.3
Intrinsic disorder mediates cooperative signal transduction in STIM1. Reviewed
Furukawa Y, Teraguchi S, Ikegami T, Dagliyan O, Jin L, Hall D, Dokholyan NV, Namba K, Akira S, Kurosaki T, Baba Y, Standley DM
Journal of molecular biology 426 ( 10 ) 2082 - 2097 2014.3
Evaluation of the stability of an SR398/GroES chaperonin complex. Reviewed
Ishino S, Kawata Y, Ikegami T, Matsuzaki K, Hoshino M
Journal of biochemistry 155 ( 5 ) 295 - 300 2014.2
Mahadev SR, Hayashi H, Ikegami T, Abe S, Morita EH
The protein journal 32 ( 8 ) 626 - 634 2013.12
Mine S, Nakamura T, Sato T, Ikegami T, Uegaki K
Journal of biochemistry 155 ( 2 ) 115 - 122 2013.11
Thermodynamic effects of multiple protein conformations on stability and DNA binding. Reviewed
Inaba S, Fukada H, Ikegami T, Oda M
Archives of biochemistry and biophysics 537 ( 2 ) 225 - 232 2013.7
Hara M, Sugimoto H, Uemura M, Akagi K, Suzuki K, Ikegami T, Watanabe T
Journal of biochemistry 154 ( 2 ) 185 - 193 2013.5
Kamioka T, Sohya S, Wu N, Maki T, Matsuda T, Ikegami T, Nakamura H, Kuroda Y
Analytical biochemistry 439 ( 2 ) 212 - 217 2013.4
Concentration-dependent oligomerization of cross-linked complexes between ferredoxin and ferredoxin-NADP+ reductase. Reviewed International journal
Kimata-Ariga Y, Kubota-Kawai H, Lee YH, Muraki N, Ikegami T, Kurisu G, Hase T
Biochemical and biophysical research communications 434 ( 4 ) 867 - 72 2013.4
Tanaka H, Akagi K, Oneyama C, Tanaka M, Sasaki Y, Kanou T, Lee YH, Yokogawa D, Dobenecker MW, Nakagawa A, Okada M, Ikegami T
The Journal of biological chemistry 288 ( 21 ) 15240 - 15254 2013.4
Utilization of lysine ¹³C-methylation NMR for protein-protein interaction studies. Reviewed
Hattori Y, Furuita K, Ohki I, Ikegami T, Fukada H, Shirakawa M, Fujiwara T, Kojima C
Journal of biomolecular NMR 55 ( 1 ) 19 - 31 2012.12
NMR study of xenotropic murine leukemia virus-related virus protease in a complex with amprenavir. Reviewed
Furukawa A, Okamura H, Morishita R, Matsunaga S, Kobayashi N, Ikegami T, Kodaki T, Takaori-Kondo A, Ryo A, Nagata T, Katahira M
Biochemical and biophysical research communications 425 ( 2 ) 284 - 289 2012.7
A back hydrogen exchange procedure via the acid-unfolded state for a large protein. Reviewed
Suzuki M, Sakurai K, Lee YH, Ikegami T, Yokoyama K, Goto Y
Biochemistry 51 ( 28 ) 5564 - 5570 2012.7
Morita EH, Kawamoto S, Abe S, Nishiyama Y, Ikegami T, Hayashi H
Biophysics (Nagoya-shi, Japan) 8 103 - 109 2012.7
Yanagi K, Sakurai K, Yoshimura Y, Konuma T, Lee YH, Sugase K, Ikegami T, Naiki H, Goto Y
Journal of molecular biology 422 ( 3 ) 390 - 402 2012.6
Mine S, Ikegami T, Kawasaki K, Nakamura T, Uegaki K
Protein expression and purification 84 ( 2 ) 265 - 269 2012.6
Flexibility of GroES mobile loop is required for efficient chaperonin function. Reviewed
Nojima T, Ikegami T, Taguchi H, Yoshida M
Journal of molecular biology 422 ( 2 ) 291 - 299 2012.5
Sakakibara Y, Kimura H, Iwamura A, Saitoh T, Ikegami T, Kurisu G, Hase T
Journal of biochemistry 151 ( 5 ) 483 - 492 2012.3
Membrane-induced alteration of the secondary structure in the SWAP-70 pleckstrin homology domain. Reviewed
Tokuda N, Kawai K, Lee YH, Ikegami T, Yamaguchi S, Yagisawa H, Fukui Y, Tuzi S
Journal of biochemistry 151 ( 4 ) 391 - 401 2012.1
Three-dimensional structure of nylon hydrolase and mechanism of nylon-6 hydrolysis. Reviewed
Negoro S, Shibata N, Tanaka Y, Yasuhira K, Shibata H, Hashimoto H, Lee YH, Oshima S, Santa R, Oshima S, Mochiji K, Goto Y, Ikegami T, Nagai K, Higuchi Y
The Journal of biological chemistry 287 ( 7 ) 5079 - 5090 2011.12
Binding energetics of ferredoxin-NADP+ reductase with ferredoxin and its relation to function. Reviewed
Lee YH, Ikegami T, Standley DM, Sakurai K, Hase T, Goto Y
Chembiochem : a European journal of chemical biology 12 ( 13 ) 2062 - 2070 2011.7
Suetake I, Mishima Y, Kimura H, Lee YH, Goto Y, Takeshima H, Ikegami T, Tajima S
The Biochemical journal 437 ( 1 ) 141 - 148 2011.7
Umetsu Y, Tenno T, Goda N, Shirakawa M, Ikegami T, Hiroaki H
Biochimica et biophysica acta 1814 ( 5 ) 724 - 730 2011.3
1H, 13C, and 15N resonance assignment of the first PDZ domain of mouse ZO-1. Reviewed
Umetsu Y, Goda N, Taniguchi R, Satomura K, Ikegami T, Furuse M, Hiroaki H
Biomolecular NMR assignments 5 ( 2 ) 207 - 210 2011.3
Konuma T, Chatani E, Yagi M, Sakurai K, Ikegami T, Naiki H, Goto Y
Journal of molecular biology 405 ( 3 ) 851 - 862 2010.11
Direct observation of minimum-sized amyloid fibrils using solution NMR spectroscopy. Reviewed
Yoshimura Y, Sakurai K, Lee YH, Ikegami T, Chatani E, Naiki H, Goto Y
Protein science : a publication of the Protein Society 19 ( 12 ) 2347 - 2355 2010.11
Kimata-Ariga Y, Sakakibara Y, Ikegami T, Hase T
Biochemistry 49 ( 46 ) 10013 - 10023 2010.10
Kaieda S, Matsui C, Mimori-Kiyosue Y, Ikegami T
Biochemistry 49 ( 25 ) 5143 - 5153 2010.6
Iwaya N, Kuwahara Y, Fujiwara Y, Goda N, Tenno T, Akiyama K, Mase S, Tochio H, Ikegami T, Shirakawa M, Hiroaki H
The Journal of biological chemistry 285 ( 22 ) 16822 - 16829 2010.3
Structure and functional characterization of Vibrio parahaemolyticus thermostable direct hemolysin. Reviewed
Yanagihara I, Nakahira K, Yamane T, Kaieda S, Mayanagi K, Hamada D, Fukui T, Ohnishi K, Kajiyama S, Shimizu T, Sato M, Ikegami T, Ikeguchi M, Honda T, Hashimoto H
The Journal of biological chemistry 285 ( 21 ) 16267 - 16274 2010.3
Coban C, Igari Y, Yagi M, Reimer T, Koyama S, Aoshi T, Ohata K, Tsukui T, Takeshita F, Sakurai K, Ikegami T, Nakagawa A, Horii T, Nuñez G, Ishii KJ, Akira S
Cell host & microbe 7 ( 1 ) 50 - 61 2010.1
Benz JP, Stengel A, Lintala M, Lee YH, Weber A, Philippar K, Gügel IL, Kaieda S, Ikegami T, Mulo P, Soll J, Bölter B
The Plant cell 21 ( 12 ) 3965 - 3983 2009.12
Yokogawa D, Ikegami T
The Journal of chemical physics 131 ( 22 ) 221101 2009.12
Unusual thermal disassembly of the SPFH domain oligomer from Pyrococcus horikoshii. Reviewed
Kuwahara Y, Unzai S, Nagata T, Hiroaki Y, Yokoyama H, Matsui I, Ikegami T, Fujiyoshi Y, Hiroaki H
Biophysical journal 97 ( 7 ) 2034 - 2043 2009.10
Preparation and conformational analysis of C-glycosyl beta(2)- and beta/beta(2)-peptides. Reviewed
Inaba Y, Kawakami T, Aimoto S, Ikegami T, Takeuchi T, Nakazawa T, Yano S, Mikata Y
Carbohydrate research 344 ( 5 ) 613 - 626 2009.1
Structure of the small ubiquitin-like modifier (SUMO)-interacting motif of MBD1-containing chromatin-associated factor 1 bound to SUMO-3. Reviewed International journal
Sekiyama N, Ikegami T, Yamane T, Ikeguchi M, Uchimura Y, Baba D, Ariyoshi M, Tochio H, Saitoh H, Shirakawa M
The Journal of biological chemistry 283 ( 51 ) 35966 - 75 2008.10
Matsui C, Kaieda S, Ikegami T, Mimori-Kiyosue Y
The Journal of biological chemistry 283 ( 47 ) 33006 - 33020 2008.9
Nakamura T, Mine S, Hagihara Y, Ishikawa K, Ikegami T, Uegaki K
Journal of molecular biology 381 ( 3 ) 670 - 680 2008.6
Molecular interaction of ferredoxin and ferredoxin-NADP+ reductase from human malaria parasite. Reviewed
Kimata-Ariga Y, Saitoh T, Ikegami T, Horii T, Hase T
Journal of biochemistry 142 ( 6 ) 715 - 720 2007.10
RNA polymerase II bypasses 8-oxoguanine in the presence of transcription elongation factor TFIIS. Reviewed
Kuraoka I, Suzuki K, Ito S, Hayashida M, Kwei JS, Ikegami T, Handa H, Nakabeppu Y, Tanaka K
DNA repair 6 ( 6 ) 841 - 851 2007.3
Lee YH, Tamura K, Maeda M, Hoshino M, Sakurai K, Takahashi S, Ikegami T, Hase T, Goto Y
The Journal of biological chemistry 282 ( 8 ) 5959 - 5967 2006.12
Mine S, Nakamura T, Hagihara Y, Ishikawa K, Ikegami T, Uegaki K
Journal of biomolecular NMR 36 70 - 70 2006.10
Morishita H, Umitsu M, Murata Y, Shibata N, Udaka K, Higuchi Y, Akutsu H, Yamaguchi T, Yagi T, Ikegami T
The Journal of biological chemistry 281 ( 44 ) 33650 - 33663 2006.8
Shimizu M, Ikegami T, Akiyama K, Morita EH
Journal of biochemistry 140 ( 3 ) 453 - 456 2006.8
1H, 13C and 15N resonance assignments of the pyrazinamidase from Mycobacterium tuberculosis. Reviewed
Son WS, Kim WJ, Kim YJ, Suh SW, Ikegami T, Akutsu H, Lee BJ
Journal of biomolecular NMR 36 60 - 60 2006.7
Takai T, Takaya T, Nakano M, Akutsu H, Nakagawa A, Aimoto S, Nagai K, Ikegami T
Journal of peptide science : an official publication of the European Peptide Society 12 ( 7 ) 443 - 454 2006.7
Nosaka AY, Nishino J, Fujiwara T, Ikegami T, Yagi H, Akutsu H, Nosaka Y
The journal of physical chemistry. B 110 ( 16 ) 8380 - 8385 2006.4
Hashimoto S, Hirose M, Hashimoto A, Morishige M, Yamada A, Hosaka H, Akagi K, Ogawa E, Oneyama C, Agatsuma T, Okada M, Kobayashi H, Wada H, Nakano H, Sabe H
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 103 ( 18 ) 7036 - 7041 2006.4
Akagi K, Watanabe J, Hara M, Kezuka Y, Chikaishi E, Yamaguchi T, Akutsu H, Nonaka T, Watanabe T, Ikegami T
Journal of biochemistry 139 ( 3 ) 483 - 493 2006.3
Specific binding of CO to tetraheme cytochrome c3. Reviewed
Takayama Y, Kobayashi Y, Yahata N, Saitoh T, Hori H, Ikegami T, Akutsu H
Biochemistry 45 ( 10 ) 3163 - 3169 2006.3
Saitoh T, Ikegami T, Nakayama M, Teshima K, Akutsu H, Hase T
The Journal of biological chemistry 281 ( 15 ) 10482 - 10488 2006.2
Nakano T, Ikegami T, Suzuki T, Yoshida M, Akutsu H
Journal of molecular biology 358 ( 1 ) 132 - 144 2006.1
Maeda M, Lee YH, Ikegami T, Tamura K, Hoshino M, Yamazaki T, Nakayama M, Hase T, Goto Y
Biochemistry 44 ( 31 ) 10644 - 10653 2005.8
Umitsu M, Morishita H, Murata Y, Udaka K, Akutsu H, Yagi T, Ikegami T
Journal of biomolecular NMR 31 ( 4 ) 365 - 366 2005.4
EspB from enterohaemorrhagic Escherichia coli is a natively partially folded protein. Reviewed
Hamada D, Kato T, Ikegami T, Suzuki KN, Hayashi M, Murooka Y, Honda T, Yanagihara I
The FEBS journal 272 ( 3 ) 756 - 768 2005.2
Fujiwara N, Miyamoto Y, Ogasahara K, Takahashi M, Ikegami T, Takamiya R, Suzuki K, Taniguchi N
The Journal of biological chemistry 280 ( 6 ) 5061 - 5070 2004.11
Regulation of Bin1 SH3 domain binding by phosphoinositides. Reviewed
Kojima C, Hashimoto A, Yabuta I, Hirose M, Hashimoto S, Kanaho Y, Sumimoto H, Ikegami T, Sabe H
The EMBO journal 23 ( 22 ) 4413 - 4422 2004.10
Ikegami T, Verdier L, Sakhaii P, Grimme S, Pescatore B, Saxena K, Fiebig KM, Griesinger C
Journal of biomolecular NMR 29 ( 3 ) 339 - 349 2004.7
Matsuda T, Ikegami T, Nakajima N, Yamazaki T, Nakamura H
Journal of biomolecular NMR 29 ( 3 ) 325 - 338 2004.7
Lee JH, Park CJ, Shin JS, Ikegami T, Akutsu H, Choi BS
Nucleic acids research 32 ( 8 ) 2474 - 2481 2004.4
Sakhaii, Peyman, Verdier, Laurent, Ikegami, Takahisa, Griesinger, Christian
Helvetica Chimica Acta 85 ( 11 ) 3895 - 3908 2002.12
Solution structure of the fibronectin type III domain from Bacillus circulans WL-12 chitinase A1. Reviewed
Jee JG, Ikegami T, Hashimoto M, Kawabata T, Ikeguchi M, Watanabe T, Shirakawa M
The Journal of biological chemistry 277 ( 2 ) 1388 - 1397 2001.10
Solution structure of the methyl-CpG binding domain of human MBD1 in complex with methylated DNA. Reviewed
Ohki I, Shimotake N, Fujita N, Jee J, Ikegami T, Nakao M, Shirakawa M
Cell 105 ( 4 ) 487 - 497 2001.5
Conformation of a peptide ligand bound to its G-protein coupled receptor. Reviewed
Inooka H, Ohtaki T, Kitahara O, Ikegami T, Endo S, Kitada C, Ogi K, Onda H, Fujino M, Shirakawa M
Nature structural biology 8 ( 2 ) 161 - 165 2001.2
Ikegami T, Okada T, Ohki I, Hirayama J, Mizuno T, Shirakawa M
Biochemistry 40 ( 2 ) 375 - 386 2001.1
Hashimoto M, Ikegami T, Seino S, Ohuchi N, Fukada H, Sugiyama J, Shirakawa M, Watanabe T
Journal of Bacteriology 182 ( 11 ) 3045 - 3054 2000.6
Mishima, Masaki, Hatanaka, Minoru, Yokoyama, Shigeyuki, Ikegami, Takahisa, Wälchli, Markus, Ito, Yutaka, Shirakawa, Masahiro
Journal of the American Chemical Society 122 ( 24 ) 5883 - 5884 2000.6
Solution structure of the chitin-binding domain of Bacillus circulans WL-12 chitinase A1. Reviewed
Ikegami T, Okada T, Hashimoto M, Seino S, Watanabe T, Shirakawa M
The Journal of biological chemistry 275 ( 18 ) 13654 - 13661 2000.5
Mishima M, Ozaki J, Ikegami T, Kabe Y, Goto M, Ueda H, Hirose S, Handa H, Shirakawa M
Journal of biomolecular NMR 14 ( 4 ) 373 - 376 1999.8
Ozaki J, Takemaru KI, Ikegami T, Mishima M, Ueda H, Hirose S, Kabe Y, Handa H, Shirakawa M
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 4 ( 7 ) 415 - 424 1999.7
Ikegami T, Kuraoka I, Saijo M, Kodo N, Kyogoku Y, Morikawa K, Tanaka K, Shirakawa M
Journal of biochemistry 125 ( 3 ) 495 - 506 1999.3
Solution structure of the DNA- and RPA-binding domain of the human repair factor XPA. Reviewed
Ikegami T, Kuraoka I, Saijo M, Kodo N, Kyogoku Y, Morikawa K, Tanaka K, Shirakawa M
Nature structural biology 5 ( 8 ) 701 - 706 1998.8
Ikegami T, Sato S, Wälchli M, Kyogoku Y, Shirakawa M
Journal of magnetic resonance (San Diego, Calif. : 1997) 124 ( 1 ) 214 - 217 1997.1
NMR 機関誌 Vol. 14：研究室便り：横浜市立大学（鶴見キャンパス）の紹介
（ Role： Sole author）
日本核磁気共鳴学会 2025.2
化学便覧 基礎編 改訂6版
日本化学会, 篠原, 久典（ Role： Contributor二次元および多次元NMR）
丸善出版 2021.1 （ ISBN:4621305212 ）
Encyclopedia of Biophysics "Protein NMR Resonance Assignment"
Ikegami, T, Inagaki, F（ Role： Contributor）
https://doi.org/10.1007/978-3-642-35943-9_312-1 2021
化学と教育「核磁気共鳴NMRで飲み物を味わう」
池上貴久（ Role： Contributor）
日本化学会 2020
生物物理「光化学系I-アナログフェレドキシン複合体の構造解析」
武藤梨沙, 河合(久保田, 寿子, 池上貴久（ Role： Joint author）
日本生物物理学会 2019
無敵のバイオテクニカルシリーズ「タンパク質実験ノート（上、改訂第４版）タンパク質をとり出そう（抽出・精製・発現編）
池上貴久（ Role： Contributor高次構造解析のためのタンパク質の調製（NMR解析のためのタンパク質調製法））
羊土社 2011.9
やさしい原理からはいる タンパク質科学実験法２「タンパク質をみる –構造と挙動-」
池上貴久, 藤原敏道（ Role： Contributorタンパク質の同位体ラベルとNMR分光法）
化学同人 2009.8
分光測定入門シリーズ第８巻「核磁気共鳴分光法」（日本分光学会編）
池上貴久（ Role： Contributorタンパク質のNMR）
講談社 2009.7
タンパク質の事典
池上貴久（ Role： ContributorNMRの原理, タンパク質の重水素化）
朝倉書店 2008.7
Zinc Finger Proteins -From Atomic Contact To Cellular Function
池上 貴久（ Role： ContributorThe Role of XPA in DNA Repair）
Landes Bioscience, Kluwer Academic Pub. 2005.3
無敵のバイオテクニカルシリーズ「タンパク質実験ノート（上）抽出, 分離と組換えタンパク質の発現」
池上貴久（ Role： Contributor高次構造解析のためのタンパク質の調製（NMR解析のためのタンパク質調製法））
羊土社 2004.4
わかる実験医学シリーズ「タンパク質がわかる」
池上貴久, 中川敦史（ Role： Contributor原子レベルでの高次構造解析）
羊土社 2003.8
シリーズ分子生物学６巻「構造生物学」
白川昌宏, 池上貴久（ Role： ContributorDNA結合タンパク質のタンパク質工学）
朝倉書店 1998.2
分子細胞生物学辞典
池上 貴久（ Role： Contributorβターン, βバレル構造, チョウ ファスマン法, 310ヘリックス, ロスマンフォールド）
東京化学同人 1997.3
NMRによる光合成関連タンパク質の相互作用解析
久田虎汰, 栗栖源嗣, 川本晃大, ノヴァスツック マルク, フランク アンナ, ニュルンベルク デニス, ヒプラー ミハエル, 小川由, 池上貴久
日本蛋白質科学会年会(Web) 26th 2026
Recycling of Used Heavy Water and its Application to Amino Acid Deuteration
SHIBAZAKI Chie, SUZUKI Himari, IKEGAMI Takahisa, YOSHIDA Katsuyoshi, OKU Takayuki, ADACHI Motoyasu, AKUTSU-SUYAMA Kazuhiro
JPS Conference Proceedings (Web) 45 2026
回収ヘリウムの純度向上への20年前の挑戦
池上, 貴久
大阪大学低温センター 50周年記念誌 33 - 34 2025.6
Recycling of used heavy water and its application to amino acid deuteration
柴崎千枝, 鈴木陽茉梨, 池上貴久, 吉田将喜, 奥隆之, 安達基泰, 阿久津和宏
量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2024 2025
シアノバクテリアSynechocystis sp.PCC6803生物時計KaiBCホモログの機能解析
吉松琳々, 飯田高広, 池上貴久, 武藤梨沙
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 48th 2025
Evaluation of ions produced by nanoESI in native mass spectrometry using thermometer ions
田尻道子, 七種和美, 池上貴久, 浅川大樹, 明石知子
質量分析総合討論会講演要旨集 72nd 2024
ヒトFAD合成酵素FLAD1による基質認識機構の構造解析
外園清香, 五十嵐学, 佐藤悠介, 園下将大, 池上貴久, 小沼剛
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024
The compactification of intrinsically disordered proteins from hyperthermophilic archaeon under high temperatures.
小田隆, 井上倫太郎, 富永大輝, 中川洋, 守島健, 岩瀬裕希, 小沼剛, 池上貴久, 石野園子, 石野良純, 奥隆之, 佐藤衛, 佐藤衛, 杉山正明
KURNS-EKR (Web) ( 19 ) 2024
池上 貴久
NMR : bulletin of the Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan / NMR学会機関誌編集室 編 14 ( 1・2 ) 84 - 88 2024
NMR講座:NMR基礎講座 ベクトルモデルはどのぐらい信じてよいのか?
池上貴久
NMR (Web) 13 ( 1 ) 2023
解糖系moonlighting蛋白質GAPDHの環境変化に対応した立体構造変化の解析
鈴木陽茉梨, 牧山ユキ, 元田容子, 小沼剛, 池上貴久
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 23rd (CD-ROM) 2023
Thermodynamic mechanism underlying the rotation of the c-subunit rotor of F<sub>0</sub>F<sub>1</sub>-ATP synthase
AKUTSU Hideo, AKUTSU Hideo, TODOKORO Yasuto, KANG Su-Jin, SUZUKI Toshiharu, IKEGAMI Takahisa, KAINOSHO Masatune, YOSHIDA Masasuke, FUJIWARA Toshimichi
生物物理(Web) 63 ( Supplement 1-2 ) 2023
Analysis of tertiary structural changes and interactions of multifunctional protein GAPDH
鈴木陽茉梨, 牧山ニコレユキ, 元田容子, 小沼剛, 池上貴久
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 62nd (CD-ROM) 2023
Chemical conformation and property of the essential Glu site of the c-ring within thermophilic Bacillus F<sub>o</sub>F<sub>1</sub>-ATP synthase determined by solid-state NMR based on its isolated c-ring structure
阿久津秀雄, 阿久津秀雄, 戸所泰人, KANG Su-Jin, 鈴木俊治, 池上貴久, 甲斐荘正恒, 吉田賢右, 藤原敏道
日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 48th 2022
AX3スピン系は訳分からないけど,やはり「メチル基」様様
池上貴久
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 61st 2022
Analysis of protein complex using MD simulation and deep learning.
小林直宏, 小沼剛, 有田恭平, 池上貴久, 山崎俊夫
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 61st 2022
核磁気共鳴NMRで飲み物を味わう
池上貴久
化学と教育 68 ( 12 ) 2020
高等植物型ヘムオキシゲナーゼの構造・相互作用解析
東田怜, 東田怜, 田中秀明, 田中秀明, 武藤梨沙, 張旭紅, 李映昊, 李映昊, 李映昊, 小沼剛, 池上貴久, 右田たい子, 栗栖源嗣, 栗栖源嗣
日本結晶学会年会講演要旨集 2020 (CD-ROM) 2020
光合成型複合体Ⅰがフェレドキシン依存的に循環型電子伝達を行う構造基盤
栗栖 源嗣, 田中 秀明, 小沼 剛, 池上 貴久, Schuller Jan M., Nowaczyk Marc M.
光合成研究 = News letter 29 ( 3 ) 242 - 246 2019.12
NDH様複合体とフェレドキシンの相互作用機構の解明
田中秀明, 濱岡紀之, 三角裕子, 金宙妍, 小沼剛, 池上貴久, ENGEL Benjamin D., NOWACZYC Marc M., 栗栖源嗣
日本生化学会大会(Web) 92nd 2019
asialo-GM1に特異的に結合する二枚貝由来レクチンSeviLの構造解析
鎌田健一, 高橋捷也, 水谷健二, 藤井佑樹, 藤田英明, 小沼剛, 池上貴久, 大関泰裕, TAME Jeremy R.H.
日本糖質学会年会要旨集 38th 2019
パルス不完全性を補償する<sup>15</sup>N/<sup>13</sup>C-CPMG-HSQCパルス系列の開発
池上貴久, 小沼剛, 栗田順一, 長土居有隆
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019
腸球菌のバンコマイシン耐性の原因蛋白質VanXの二量体構造の解析
土屋智恵子, 小沼剛, 西田真之, 長土居有隆, 池上貴久
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019
時計タンパク質Kai複合体の機能と構造解析
岩戸将貴, 飯田高広, 三島正規, 池上貴久, 武藤梨沙
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019
光合成型複合体Iがフェレドキシン依存性を示す構造基盤
栗栖源嗣, 田中秀明, 小沼剛, 池上貴久, SCHULLER Jan M., NOWACZYK Marc M.
日本生化学会大会(Web) 92nd 2019
好熱菌H<sup>+</sup>-ATP合成酵素サブユニットcリングの膜内構造の精密化
戸所泰人, KANG Su-jin, KANG Su-jin, 鈴木俊治, 吉田賢右, 池上貴久, 藤原敏道, 阿久津秀雄, 阿久津秀雄
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019
Structural Analyses of Photosystem I-Ferredoxin Complex
武藤梨沙, 河合(久保田, 寿子, 池上貴久
生物物理(Web) 59 ( 1 ) 032‐034(J‐STAGE) - 34 2019
Structural Analyses of Photosystem I-Ferredoxin Complex
MUTOH Risa, KAWAI-KUBOTA Hisako, IKEGAMI Takahisa
Seibutsu Butsuri 59 ( 1 ) 32 - 34 2019
<sup>13</sup>C直接観測測定の高感度化法の開発
古板恭子, 服部良一, 服部良一, 杉木俊彦, 池上貴久, 池上貴久, 藤原敏道, 児嶋長次郎, 児嶋長次郎
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019
大木出, 藤咲貴大, 池上貴久, 白川昌宏, 水落憲和
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 57th 106‐107 2018.9
長いT<sub>1</sub>を持つ分子の高感度溶液NMR測定法の開発
古板恭子, 服部良一, 池上貴久, 服部良一, 池上貴久, 藤原敏道, 児嶋長次郎, 児嶋長次郎
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 57th 104‐105 2018.9
循環型電子伝達に関わるNDH‐1複合体の構造および相互作用解析
田中秀明, 梅野恵太, 三角裕子, KIM Ju Yaen, ROEGNER Matthias, 池上貴久, NOWACZYK Marc, 栗栖源嗣
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 18th 88 2018.5
緩和分散CPMG法におけるスピン状態に依存したアーティファクト削減の解析
長土居有隆, 池上貴久
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 56th 134‐135 2017.11
大木出, 藤咲貴大, 池上貴久, 白川昌宏
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 56th 128‐129 2017.11
三木彩子, 稲葉理美, 櫻井一正, 池上貴久, 伊島理枝子, 織田昌幸
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2017 ROMBUNNO.2J33p09 (WEB ONLY) 2017.3
大木出, 池上貴久, 白川昌宏
日本分光学会NMR分光部会シンポジウム 2017 31‐32 2017
長土居有隆, 池上貴久
NMR (Web) 7 72‐76 (WEB ONLY) 2016.10
タンパク質の化学修飾を用いた安定同位体標識および常磁性金属標識によるNMR解析
服部良一, 服部良一, 大木出, 大木出, 山口拓実, 山口拓実, 山口拓実, ZHANG Ying, ZHANG Ying, 古板恭子, 池上貴久, 池上貴久, 小林直宏, 深田はるみ, 白川昌宏, 加藤晃一, 加藤晃二, 亀田倫史, 田中好幸, 藤原敏道, 児嶋長次郎, 児嶋長次郎
生体分子科学討論会講演要旨集 43rd 40‐41 2016.6
長土居 有隆, 池上 貴久
NMR : bulletin of the Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan 7 72 - 76 2016
Delicate Balance of Noncovalent Forces Control the Electron Transfer Complex between Ferredoxin and Sulfite Reductase to Optimize Enzymatic Activity
Juyaen Kim, Misaki Kinoshita, Takahisa Ikegami, Genji Kurisu, Yuji Goto, Toshiharu Hase, Young-Ho Lee
PROTEIN SCIENCE 24 64 - 65 2015.10
杉本華幸, 杉本華幸, 小林豊, 鈴木一史, 鈴木一史, 池上貴久, 渡邉剛志, 渡邉剛志
キチン・キトサン研究 21 ( 2 ) 130 - 131 2015.7
光化学系I‐フェレドキシンの電子伝達複合体構造から読み解く電子伝達の動的メカニズム
河合寿子, 武藤梨沙, セティフ ピエール, ノバチク マーク, レグナー マティアス, 池上貴久, 田中秀明, 栗栖源嗣
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 15th 62 2015.5
光化学系I‐フェレドキシンの電子伝達複合体構造から読み解く電子伝達の動的メカニズム
河合寿子, 武藤梨沙, セティフ ピエール, ノバチク マーク, レグナー マティアス, 池上貴久, 田中秀明, 栗栖源嗣
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 15th 31 2015.5
NMR Analyses Using Residual Dipolar Coupling
長土居有隆, 池上貴久
分光研究 64 ( 4 ) 490 - 501 2015
長土居有隆, 池上貴久
NMR (Web) 6 56 - 64 2015
ガリウム置換フェレドキシンの結晶構造とPSIおよびFNRとの相互作用解析
武藤梨沙, 村木則文, 河合(久保田, 寿子, 長谷俊治, 池上貴久, 栗栖源嗣
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 53rd 246 - 247 2014.11
石井聡悟, 手島圭三, 池上貴久, 堀貫治
日本生化学会大会(Web) 87th 2P-016 (WEB ONLY) - 016] 2014.10
N,N’‐Diacetylchitobiose Deacetylaseの可溶性発現と立体構造解析
中村努, 新山真由美, 橋本わかな, 池上貴久, 駒大輔, 大本貴士, 森田潤司, 上垣浩一
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 14th 55 2014.5
ラクダ科動物由来シングルドメイン抗体(VHH抗体)の熱変性は化学修飾による
赤澤陽子, 高島瑞紀, LEE Young‐Ho, 池上貴久, 後藤祐児, 上垣浩一, 萩原義久
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 14th 76 2014.5
温度変化実験により明らかとなったc‐Myb DNA結合ドメイン構造揺らぎの特性
稲葉理美, 前野覚大, 櫻井一正, 池上貴久, 深田はるみ, 森井尚之, 赤坂一之, 織田昌幸
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 14th 104 2014.5
光化学系Iとフェレドキシンが形成する電子伝達複合体の構造基盤
河合(久保田, 寿子, 武藤梨沙, 池上貴久, NOWACZYK Marc, ROEGNER Matthias, 田中秀明, 栗栖源嗣
日本結晶学会年会講演要旨集 2014 111 2014
不均一サンプリングを用いた多次元NMRによる低分子化合物の解析
片平律子, 佐藤一, 児嶋長次郎, 池上貴久, 藤原敏道
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 52nd 128 - 129 2013.11
メチル化リジンの化学シフトと塩橋との相関に関する理論的・実験的研究
服部良一, SEBERA Jakub, SYCHROVSKY Vladimir, 古板恭子, 大木出, 池上貴久, 藤原敏道, 児嶋長次郎
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 52nd 204 - 207 2013.11
江川文子, 深澤隼, 片平律子, 児嶋長次郎, 池上貴久, 藤原敏道
固体NMR・材料フォーラム報告 ( 54 ) 37 2013.10
ラクダ科動物由来のシングルドメイン抗体(VHH抗体)の熱耐性機構の検証
赤澤陽子, 高島瑞紀, 李映昊, 池上貴久, 後藤祐児, 上垣浩一, 萩原義久
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 13th 136 2013.5
高圧NMRおよび蛍光法によるc‐Myb DNA結合ドメイン準安定励起構造の解析
稲葉理美, 前野覚大, 池上貴久, 赤坂一之, 織田昌幸
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 13th 103 2013.5
家族性ALSに関与するOptineurin ZnFドメインの構造・機能解析
天野剛志, 市川大哉, 池上貴久, 廣明秀一
日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 133rd ( 2 ) ROMBUNNO.29S-AM07 - 277 2013.3
田中宏明, 赤木謙一, 小根山千歳, 田中雅千, 佐々木優一, 狩野孝, LEE Young‐Ho, 横川大輔, DOBENECKER Marc‐Werner, 中川敦史, 岡田雅人, 池上貴久
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 1P-0078 (WEB ONLY) 2013
クローディンとイノシトールリン脂質はZO‐1PDZ1への結合において競合する
合田(天野, 名都子, 里村香織, 天野剛志, 浜田大三, 池上貴久, 古瀬幹夫, 廣明秀一
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2P-0070 (WEB ONLY) 2013
ピリジンヌクレオチドにより調節されるフェレドキシンとフェレドキシン:NADP+還元酵素の分子間相互作用について
筑摩悠太朗, LEE Young Ho, 有賀洋子, 池上貴久, 後藤祐児, 長谷俊治
日本生化学会大会(Web) 86th 2P-126 (WEB ONLY) 2013
フェレドキシンと亜硫酸還元酵素の電子伝達複合体の構造と分子間相互作用の解析(Structure of an electron transfer complex of ferredoxin and sulfite reductase and analysis of their molecular interactions)
金 宙妍, 中山 雅登, 李 映昊, 池上 貴久, 後藤 祐児, 栗栖 源嗣, 長谷 俊治
日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 85回 2T07 - 03 2012.12
リジン<sup>13</sup>Cメチル化法のタンパク質・タンパク質相互作用解析への適用
服部良一, 古板恭子, 大木出, 池上貴久, 深田はるみ, 白川昌宏, 藤原敏道, 児嶋長次郎
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 51st 186 - 187 2012.10
長い縦緩和時間を利用した高感度溶液NMR測定法の開発と<sup>13</sup>C直接観測への応用
古板恭子, 服部良一, 池上貴久, 藤原敏道, 児嶋長次郎
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 51st 238 - 239 2012.10
櫻井一正, 北山寛貴, 八木正典, 池上貴久, 西村千秋, 後藤祐児
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 51st 114 - 115 2012.10
片平律子, 江川文子, 児嶋長次郎, 池上貴久, 藤原敏道
固体NMR・材料フォーラム報告 ( 52 ) 36 2012.10
アミロイド線維形成時に現れる過渡的中間体のキャラクタリゼーション
柳浩太郎, 櫻井一正, 吉村優一, 小沼剛, LEE Young‐Ho, 菅瀬謙治, 池上貴久, 内木宏延, 後藤祐児
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 12 2012.5
アミロイド線維形成時に現れる過渡的中間体のキャラクタリゼーション
柳浩太郎, 櫻井一正, 吉村優一, 小沼剛, LEE Young‐Ho, 菅瀬謙治, 池上貴久, 内木宏延, 後藤祐児
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 104 2012.5
野坂篤子, 池上貴久, 片平律子, 藤原敏道, 野坂芳雄
電気化学会大会講演要旨集 79th 387 2012.3
リジンの13Cメチル化標識法を使ったNMRによる蛋白質間相互作用解析の有効性
大木出, 服部良一, 古板恭子, 池上貴久, 深田はるみ, 白川昌宏, 藤原敏道, 児嶋長次郎
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2W4II-4 (WEB ONLY) 2012
抗体及び抗体フラグメント(Fab,scFv,VHH)の耐熱性の検証
萩原義久, 赤澤陽子, 高島瑞紀, LEE Young‐ho, 池上貴久, 後藤祐児, 上垣浩一
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 4P-0595 (WEB ONLY) 2012
野坂篤子, 楊文静, 池上貴久, 藤原敏道, 野坂芳雄
固体・表面光化学討論会講演要旨集 30th 40 - 41 2011.11
交換反発エネルギーのための等方的サイト‐サイトポテンシャルの量子化学的手法に基づく構築
横川大輔, 池上貴久
溶液化学シンポジウム講演要旨集 34th 47 2011.11
亜硝酸還元酵素(NiR)およびフェレドキシン依存性グルタミン酸合成酵素(Fd-GOGAT)とフェレドキシンの蛋白質間相互作用に関する構造的機能的研究(Structure and functional studies on protein-protein interaction of Ferredoxin with nitrite reductase (NiR) and ferredoxin-dependent glutamate synthase (Fd-GOGAT))
榊原 由紀子, 吉田 綾子, 斉藤 貴史, 池上 貴久, 栗栖 源嗣, 長谷 俊治
日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 84回 4T15a - 21 2011.9
Comparative study of chitin-binding domains from various chitinases based on their 3D-structures
UEMURA M., OHTSUKA M., MARUYA R., OKUMURA A., IKEGAMI T., KARITA S., KEZUKA Y., NONAKA T., SUGIMOTO H., SUZUKI K., WATANABE T.
キチン・キトサン研究 17 ( 2 ) 234 - 234 2011.7
CD28細胞内領域とアダプター分子Gads SH2及びGrb2 SH2との分子間相互作用解析
肥後邦武, 砂橋朗進, 森井尚之, 池上貴久, 伊倉貞吉, 伊藤暢聡, 安部良, 織田昌幸
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 11th 45 2011.5
茶谷絵理, 小沼剛, 大西玲奈, 八木正典, 櫻井一正, 池上貴久, 内木宏延, 後藤祐児
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 11th 34 2011.5
田邊陽一, MYINT Wazo, 伊島理枝子, 金折賢二, 池上貴久, 織田昌幸
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 11th 62 2011.5
服部良一, 大木出, 古板恭子, 池上貴久, 深田はるみ, 白川昌宏, 藤原敏道, 児嶋長次郎
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 11th 45 2011.5
蛋白質シミュレーションにより得られた構造アンサンブルの評価~NMR観測結果との比較~
池部仁善, 池上貴久, 肥後順一, 中村春木
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 11th 121 2011.5
溶液NMRによるβ2ミクログロブリンアミロイド線維形成のモノマー‐線維核相互作用機構の解明
櫻井一正, 柳浩太郎, 吉村優一, 小沼剛, 菅瀬謙治, 池上貴久, 内木宏延, 後藤祐児
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 11th 104 2011.5
植村迪夫, 丸屋良輔, 遠藤陽太, 苅田修一, 蟹江美佐, 池上貴久, 奥村明子, 毛塚雄一郎, 野中孝昌, 鈴木一史, 渡邉剛志
日本農芸化学会大会講演要旨集 2011 203 2011.3
NF‐κBシグナリングに関わるユビキチン結合型Zn<sup>2+</sup>フィンガードメインの構造・機能解析
天野剛志, 市川大哉, 池上貴久, 廣明秀一
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 49th 278 - 279 2010.11
<sup>13</sup>Cメチル基をプローブとして用いるリジン側鎖を介した塩橋の解析法の開発
服部良一, 大木出, 古板恭子, 池上貴久, 深田はるみ, 白川昌宏, 藤原敏道, 児嶋長次郎
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 49th 140 - 143 2010.11
オントロジー工学を利用したNMRデータ解析,評価およびデータベース登録を支援するツール,MagROシステムの開発
小林直宏, 原野陽子, 池上貴久, 児嶋長次郎, 佐藤純子, 中村春木, 阿久津秀雄, 藤原敏道
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 49th 406 - 407 2010.11
950MHz NMRによる蛋白質の<sup>13</sup>C直接観測
古板恭子, 池上貴久, 藤原敏道, 児嶋長次郎
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 49th 180 - 181 2010.11
エネルギー表示,座標表示の積分方程式を利用した溶媒和自由エネルギー計算法の開発
横川大輔, 池上貴久
溶液化学シンポジウム講演要旨集 33rd 95 2010.11
ラン藻(Oscillatoria agardhii)レクチンのNMR構造解析
瀬野利直, 手島圭三, 池上貴久, 堀貫治
日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集 27th 34 2010.6
超好熱菌Pyrococcus furiosus由来キチナーゼが有するキチン結合ドメインChBD1の構造解析
峯昇平, 石川一彦, 池上貴久, 上垣浩一
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 139 2010.5
抗原ペプチド結合前後のモノクローナル抗体P20.1の立体構造
寒川剛, 禾晃和, 池上貴久, 高木淳一
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 136 2010.5
ドメイン構造に基づいたAAA‐ATPaseの分類と機能メカニズムの予測
廣明秀一, 藤原芳江, 岩谷奈央子, 合田名都子, 池上貴久, 白川昌宏
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 65 2010.5
リジン選択的<sup>13</sup>Cメチルラベル法を用いた蛋白質間相互作用の解析
服部良一, 大木出, 古板恭子, 池上貴久, 深田はるみ, 白川昌宏, 藤原敏道, 児嶋長次郎
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 69 2010.5
PRESAT‐vectorを用いた天然変性タンパク質配列の網羅的検証系の確立
合田名都子, 清水佳奈, 桑原陽太, 天野剛志, 池上貴久, 太田元規, 廣明秀一
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 68 2010.5
β<sub>2</sub>‐ミクログロブリンが形成するアミロイド線維の溶液NMRによる直接観察
吉村優一, 櫻井一正, 李映昊, 池上貴久, 茶谷絵理, 内木宏延, 後藤祐児
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 90 2010.5
パルスラベルH/D交換法とNMRを用いたβ2ミクログロブリンの線維伸長中間体の解析
小沼剛, 茶谷絵理, 八木正典, 櫻井一正, 池上貴久, 内木宏延, 後藤祐児
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 171 2010.5
APC腫瘍抑制遺伝子とDDEFのSH3ドメインとの相互作用の構造学的基礎(Structural basis for the interaction between APC tumor suppressor and SH3 domains of DDEFs)
松井 千幸, 海江田 修至, 池上 貴久, 清末 優子
日本細胞生物学会大会講演要旨集 62回 138 - 138 2010.5
植村迪夫, 丸屋良輔, 山田伸明, 原政司, 池上貴久, 毛塚雄一郎, 野中孝昌, 鈴木一史, 渡邉剛志
日本農芸化学会大会講演要旨集 2010 160 2010.3
1P063 1YA0930 Identification of transient intermediates of the formation of the β2-microglobulin amyloid fibril by heteronuclear NMR techniques.(Protein:Property,Early Research in Biophysics Award Candidate Presentations,Early Research in Biophysics Award,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)
SAKURAI Kazumasa, YANAGI Kotaro, YOSHIMURA Yuichi, KONUMA Tsuyoshi, IKEGAMI Takahisa, NAIKI Hironobu, GOTO Yuji
Seibutsu Butsuri 50 ( 2 ) S30 2010
服部良一, 大木出, 古板恭子, 池上貴久, 深田はるみ, 白川昌宏, 藤原敏道, 児嶋長次郎
日本分光学会年次講演会 2010 101 2010
緩和解析による藍色細菌Synechococcus PCC.7942の転写因子SmtBの亜鉛イオン濃度検知機構解明
森田勇人, 林秀則, 阿部俊之助, 池上貴久
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 48th 78 - 79 2009.11
腫瘍抑制因子APC‐SAMPモチーフとDDEF1‐SH3ドメインの複合体立体構造解析
海江田修至, 松井千幸, 清末優子, 池上貴久
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 48th 218 - 219 2009.11
エネルギー表示の積分方程式理論に基づくエントロピー計算法の開発
横川大輔, 池上貴久
溶液化学シンポジウム講演要旨集 32nd 28 2009.11
Oscillatoria agardhiiレクチンのNMR構造解析
瀬野利直, 手島圭三, 池上貴久, 堀貫冶
生化学 ROMBUNNO.4P-090 2009.9
土壌放線菌由来キチン分解酵素Chi18aCの基質吸着ドメインのNMRによる立体構造の解析
奥村明子, 近石絵理子, 高井朋代, 吉尾幸子, 森田潤司, 植村迪夫, 鈴木一史, 渡邉剛志, 池上貴久
生化学 82回 ROMBUNNO.2P-230 - 230 2009.9
Structure-function analysis of synthetic complexes obtained through inter-molecular disulfide bond between ferredoxin and ferredoxin-NADP+ reductase. Invited
Kimata-Ariga Y, Sakakibara Y, Ikegami T, Hase T
J Biol Inorg Chem 14 ( S103 ) 2009.7
β<sub>2</sub>‐ミクログロブリンが形成するアミロイド線維の溶液NMRによる運動性の解析
吉村優一, 櫻井一正, 茶谷絵理, 亀田篤司, 池上貴久, 内木宏延, 後藤祐児
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 9th 74 2009.4
熱により不可逆的に解離するPH0470由来のSPFHドメイン多量体
桑原陽太, 雲財悟, 永田崇, 池上貴久, 廣明洋子, 藤吉好則, 廣明秀一
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 9th 111 2009.4
ペプチドリガンドの結合に伴うP20.1モノクローナル抗体の構造変化の解析
寒川剛, 禾晃和, 池上貴久, 高木淳一
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 9th 116 2009.4
池上 貴久, イケガミ タカヒサ
大阪大学低温センターだより 146 ( 146 ) 10 - 14 2009.4
Streptomyces griseus HUT6037由来キチナーゼCの構造と機能の解明
吉田優, 川見寿子, 菅丈司, 水野亮二, 毛塚雄一郎, 野中孝昌, 池上貴久, 鈴木一史, 渡邉剛志
日本農芸化学会大会講演要旨集 2009 47 2009.3
上垣浩一, 辻裕明, 中村努, 石川一彦, 池上貴久, 西村重徳, 乾隆
日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集 460th 8 - 9 2009
腫瘍抑制因子APC‐SAMPモチーフとDDEF1‐SH3ドメインの相互作用解析
海江田修至, 松井千幸, 清末優子, 池上貴久
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 47th 102 - 103 2008.11
Structural and functional analysis of chitinase C from Streptomyces griseus HUT6037
YOSHIDA Yu, MIZUNO Ryoji, SUGA Takeshi, KEZUKA Yuichiro, NONAKA Takamasa, IKEGAMI Takahisa, SUZUKI Kazushi, WATANABE Takeshi
キチン・キトサン研究 14 ( 2 ) 238 - 238 2008.7
NMR analysis of ferredoxin tethered to ferredoxin-NADP+ reductase in various configurations Invited
Yoko Kimata-Ariga, Yukiko Sakakibara, Takahisa Ikegami, Toshiharu Hase
99 - 106 2008.6
惣谷志保里, 石原謙一郎, 泉川直重, 松田知己, 池上貴久, 中村春木, 黒田裕
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 8th 116 2008.5
Streptomyces griseus HUT6037由来キチナーゼCの構造と機能の解明
吉田優, 菅丈司, 水野亮二, 毛塚雄一郎, 野中孝昌, 池上貴久, 鈴木一史, 渡邉剛志
日本農芸化学会大会講演要旨集 2008 34 2008.3
磯貝信, 有吉眞理子, 杤尾豪人, 菅野新一郎, 池上貴久, 伊藤隆, 安井明, 白川昌宏
生化学 4T4-5 2008
NMRによるVPAC2細胞外ドメインのリガンド認識機構の解析
天野剛志, 岩田麻知子, 合田名都子, 池上貴久, 廣明秀一
生化学 4P-0152 2008
新規細胞膜透過ペプチドIGFBP3,IGFBP5のNMR構造解析
坂越廣之, 合田名都子, 天野剛志, 池上貴久, 廣明秀一
生化学 4P-0151 2008
植物グルタミン酸合成酵素とフェレドキシンとの分子間相互作用と電子伝達の解析
吉田綾子, 榊原由紀子, 池上貴久, 長谷俊治
生化学 3T7-1 2008
倉富博康, 池上貴久, 荒木弘之, 栃尾尚哉, 木川隆則, 横山茂之, 有吉眞理子, 杤尾豪人, 白川昌宏
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 46th 214 - 215 2007.9
磯貝信, 有吉眞理子, 杤尾豪人, 池上貴久, 伊藤隆, 菅野新一郎, 安井明, 白川昌宏
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 46th 202 - 203 2007.9
C‐グリコシルβ‐アミノ酸を用いたβ‐ペプチドの合成と立体構造解析
稲葉陽子, 矢野重信, 中沢隆, 川上徹, 相本三郎, 池上貴久, 三方裕司
生体機能関連化学シンポジウム講演要旨集 22nd 182 - 183 2007.9
SUMO(Small Ubiquitin‐like Modifier)修飾によるタンパク質機能変換の構造生物学的研究
杤尾豪人, 有田恭平, 関山直孝, 馬場大地, 斉藤寿仁, 池上貴久, 白川昌宏
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 7th 29 2007.5
C‐グリコシド結合を有するβ‐アラニン型糖アミノ酸を用いた糖ペプチドの合成と立体構造解析
稲葉陽子, 矢野重信, 中沢隆, 川上徹, 相本三郎, 池上貴久, 三方裕司
日本化学会講演予稿集 87th ( 2 ) 1346 2007.3
Streptomyces griseus HUT6037キチナーゼCのキチン吸着機構
菅丈司, 山田伸明, 水野亮二, 野中孝昌, 毛塚雄一郎, 池上貴久, 鈴木一史, 渡邉剛志
日本農芸化学会大会講演要旨集 2007 62 2007.3
フェレドキシン(Fd)‐FNR電子伝達のpH依存性を制御するFd側アミノ酸残基の探索
原由希子, 手島圭三, 長浦華織, 池上貴久, 長谷俊治
生化学 1P-1101 2007
フェレドキシンと亜硝酸還元酵素との蛋白質間相互作用と電子伝達機構
榊原由紀子, 斉藤貴士, 池上貴久, 栗栖源嗣, 長谷俊治
生体分子科学討論会講演要旨集 34th 70 - 71 2007
SUMO‐3(Small Ubiquitin‐like Modifier‐3)とSUMO‐interacting motif複合体の構造解析
関山直孝, 斉藤寿仁, 池上貴久, 有吉眞理子, 杤尾豪人, 白川昌宏
生化学 1P-0067 2007
惣谷志保里, 石原謙一郎, 泉川直重, 松田知己, 池上貴久, 中村春木, 黒田裕
生化学 4P-0354 2007
植物グルタミン酸合成酵素及びその改変酵素を用いたフェレドキシンとの分子間相互作用と電子伝達の解析
吉田綾子, 榊原由紀子, 斎藤貴士, 池上貴久, 長谷俊治
生化学 4P-0401 2007
APC(adenomatous polyposis coli)癌抑制因子のSAMP領域に結合するタンパク質の探索と相互作用解析
松井千幸, 海江田修至, 池上貴久, 清末優子
生化学 2P-0407 2007
SUMO‐3(Small Ubiquitin‐like Modifier‐3)とSBM(SUMO binding motif)複合体の構造解析
関山直孝, 斉藤寿仁, 池上貴久, 杤尾豪人, 白川昌宏
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 45th 178 - 179 2006.11
Study on the chitin-binding mechanism of chitinase C from Streptomyces griseus HUT6037
SUGA T., TAKAKUSAKI H., MIZUNO R., NONAKA T., KEZUKA Y., IKEGAMI T., WATANABE T.
キチン・キトサン研究 12 ( 2 ) 206 - 206 2006.7
Comparative study on the chitin-binding domains of CBM families 5 and 12
WATANABE T., HARA M., MIZUNO R., KEZUKA Y., NONAKA T., IKEGAMI T.
キチン・キトサン研究 12 ( 2 ) 158 - 159 2006.7
癌細胞浸潤阻害剤の標的に成り得るAMAP1/コータクチンのインタフェイスの構造
廣瀬まゆみ, 橋本茂, 橋本あり, 森重真毅, 山田敦子, 保坂晴美, 赤木謙一, 小川栄治, 池上貴久, 中川敦史, 佐邊壽孝
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 6th 67 2006.3
原核生物由来キチナーゼA1のキチン結合ドメインの固体NMRによる構造解析
田中宏樹, 薮田いずみ, 長崎佑子, 原政司, 池上貴久, 藤原敏道, 渡邊剛志, 阿久津秀雄
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 6th 97 2006.3
Behavior of adsorbed water on rutile TiO2 photocatalyts on temperature increase
野坂篤子, 藤原敏道, 池上貴久, 八木宏昌, 阿久津秀雄, 野坂芳雄
日本化学会講演予稿集 86th ( 1 ) 208 2006.3
カドヘリンの多様な接着レパートリー:プロトカドヘリンの蛋白質立体構造からの示唆
森下博文, 海津正賢, 村田陽二, 柴田直樹, 宇高恵子, 樋口芳樹, 阿久津秀雄, 山口徹, 池上貴久, 八木健
日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 105 2005.11
浸潤性乳癌細胞のAMAP1/コータクチン相互作用インターフェースの癌浸潤阻害剤の標的としての評価
橋本茂, 広瀬まゆみ, 橋本あり, 森重真毅, 山田敦子, 小野寺康仁, 小川栄治, 和田洋巳, 池上貴久, 中川敦史, 佐辺寿孝
日本癌学会学術総会記事 64th 309 2005.8
Binding mechanism of chitin binding domain of chitinase A1 from Bacillus circulans WL-12
HARA Masashi, NAGASAKI Yuko, MIYASHITA Yasuyuki, YABUTA Izumi, IKEGAMI Takahisa, WATANABE Takeshi
キチン・キトサン研究 11 ( 2 ) 188 - 189 2005.7
Thermodynamics of interactions of natively partially folded EspB from enterohaemorrhagic E-coli with human beta-catenin tail domain
D Hamada, KN Suzuki, T Ikegami, Yanagihara, I
FEBS JOURNAL 272 254 - 254 2005.7
Changes of surface and adsorbed water layers of TiO2 photocatalytic systems on thermal treatments
野坂篤子, 藤原敏道, 池上貴久, 八木宏昌, 阿久津秀雄, 野坂芳雄
日本化学会講演予稿集 85th ( 1 ) 390 2005.3
Bacillus circulans WL‐12由来キチナーゼA1キチン吸着ドメインの吸着機構の解析
原政司, 長崎祐子, 宮下泰幸, 二階堂直樹, 薮田いづみ, 池上貴久, 渡辺剛志
日本農芸化学会大会講演要旨集 2005 198 2005.3
3P020 Determination of the conformation and configuration of arthrofactin by NMR
Kondo Y., Morikawa M., Ikegami T.
Seibutsu Butsuri 45 ( 0 ) S208 2005
Saitoh Takashi, Nakayama Masato, Toyota Hiroshi, Ikegami Takahisa, Hase Toshiharu
Plant and Cell Physiology Supplement 2005 ( 0 ) 253 - 253 2005
Bacillus circulans WL‐12由来キチナーゼAlキチン吸着ドメインの吸着機構の解析
原政司, 長崎祐子, 宮下泰幸, 薮田いづみ, 池上貴久, 渡邉剛志
日本農芸化学会関東支部受賞記念講演およびシンポジウム講演要旨集 2005 ( Oct ) 6 2005
The protein-protein interaction and electron transfer mechanism between ferredoxin and sulfite reductase
T Saitoh, M Nakayama, H Toyota, T Ikegami, T Hase
PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 46 S87 - S87 2005
天然状態で中間的構造を形成する腸管出血性大腸菌O157タイプIII分泌系蛋白質EspB
浜田 大三, 池上 貴久, 柳原 格
生物物理 44 ( Suppl.1 ) S201 - S201 2004.11
高温処理によるTiO<sub>2</sub>光触媒系の表面と分解活性の変化
野坂篤子, 藤原敏道, 池上貴久, 八木宏昌, 阿久津秀雄, 野坂芳雄
光化学討論会講演要旨集 2004 53 2004.10
TiO<sub>2</sub>光触媒系の吸着水の構造に関するNMRによる研究
野坂篤子, 藤原敏道, 池上貴久, 八木宏昌, 阿久津秀雄, 野坂芳雄
触媒討論会討論会A予稿集 94th 121 2004.9
池上貴久
分光研究 53 ( 4 ) 259 - 261 2004.8
CNR/Pcdhαファミリータンパク質の構造-機能連関解析(Structural and functional characterization of CNR/Pcdhα family protein)
海津 正賢, 森下 博文, 村田 陽二, 草野 清輔, 樋口 芳樹, 池上 貴久, 八木 健
神経化学 43 ( 2-3 ) 533 - 533 2004.8
The solution structure and domains function of Bacillus circulans WL-12 chitinase A1
TORATANI Tadayuki, YAMAZAKI Naoko, NAGASAKI Yuko, HARA Masashi, TAKENAKA Hiromi, NIKAIDOU Naoki, IKEGAMI Takahisa, SUGIYAMA Junji, NONAKA Takamasa, HIRAGI Yuzuru, WATANABE Takeshi
キチン・キトサン研究 = Chitin and chitosan research 10 ( 2 ) 142 - 143 2004.7
Structure and properties of family 19 chitinases from Actinobacteria
TAKAKUSAKI Hideki, MIZUNO Ryoji, WATANABE Jun, KAWASE Tomokazu, KEZUKA Yuitiro, NIKAIDOU Naoki, MITSUTOMI Masaru, FUKADA Harumi, IKEGAMI Takahisa, NONAKA Takamasa, WATANABE Takesi
キチン・キトサン研究 = Chitin and chitosan research 10 ( 2 ) 144 - 145 2004.7
核磁気共鳴(NMR)による蛋白質とリガンドとの相互作用の解析
池上 貴久, イケガミ タカヒサ
大阪大学低温センターだより 127 ( 127 ) 2 - 7 2004.7
Behaviors of adsorbed water on TiO2 photocatalytic systems on temperature increase
野坂篤子, 藤原敏道, 池上貴久, 八木宏昌, 阿久津秀雄, 野坂芳雄
日本化学会講演予稿集 84th ( 1 ) 486 2004.3
ファミリー19キチナーゼの抗真菌活性におけるキチン吸着ドメインの役割
渡部潤, 高草木秀樹, 川瀬智一, 二階堂直樹, 宮下清貴, 深田はるみ, 野中孝昌, 池上貴久, 渡辺剛志
日本農芸化学会大会講演要旨集 2004 111 2004.3
遺伝子:1型糖尿病 1型糖尿病遺伝子Idd16のコンジェニックマッピングならびに候補遺伝子解析
井上かおり, 池上博司, 藤沢智巳, 野嶋孝次, 馬場谷美知子, 馬場谷成, 池上貴久, 牧野進, 荻原俊男
日本糖尿病動物研究会記録 17th 30 2004.1
3P045 EspB from enterohaem-orrhagic Escherichia coli O157 is a natively partially folded protein
Hamada D., Ikegami T., Yanagihara I.
Seibutsu Butsuri 44 ( 0 ) S201 2004
3P229 Sample preparation and structural analysis of CNR/Protocadherin alpha ectodomain
Morishita H., Shibata N., Umitsu M., Murata Y., Ikegami T., Yagi T., Higuchi Y.
Seibutsu Butsuri 44 ( 0 ) S247 2004
NMR測定から得られるSaturation transferとResidual dipolar couplingの情報を利用した蛋白質‐蛋白質ドッキングシミュレーション
松田知己, 池上貴久, 中島伸介, 中村春木
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 26th 554 2003.11
遺伝子:1型糖尿病 1型糖尿病遺伝子Idd16のコンジェニックマッピングならびに候補遺伝子解析
井上かおり, 池上博司, 藤沢智巳, 野嶋孝次, 馬場谷美知子, 馬場谷成, 池上貴久, 牧野進, 荻原俊男
Diabetes Front 14 ( 5 ) 669 2003.10
1型糖尿病遺伝子Idd16のコンジェニックマッピングならびに候補遺伝子解析
井上 かおり, 池上 博司, 藤澤 智巳, 野嶋 孝次, 馬場谷 美知子, 馬場谷 成, 池上 貴久, 牧野 進, 荻原 俊男
Diabetes Frontier 14 ( 5 ) 669 - 669 2003.10
Urea unfolding of ferredoxin-NADP^+ reductase
Tamura K., Maeda M., Hoshino M., Ikegami T., Yamazaki T., Hase T., Goto Y.
Seibutsu Butsuri 43 ( 0 ) S70 2003
Exploring diversity of biological NMR -New insights into its technological advances and further applications
Ikegami T., Kikuchi J.
Seibutsu Butsuri 43 ( 0 ) S20 2003
Structure of the methyl-CpG binding domain in complex with methylated DNA.
大木出, 下竹敦哉, 藤田直之, JEE J‐G, 池上貴久, 中尾光善, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 40th 314 - 315 2001.11
Structure of Photoactive Yellow Protein.
塩沢久美子, 栃尾豪人, JEE J‐G, 池上貴久, 今元泰, 片岡幹雄, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 40th 358 - 359 2001.11
池上貴久, 白川昌宏
蛋白質 核酸 酵素 46 ( 8 ) 986 - 994 2001.6
ヌクレオチド除去修復蛋白質の立体構造解析--XPAとRPA (第1部 DNA除去修復機構とその破綻)
池上 貴久, 白川 昌宏
蛋白質核酸酵素 46 ( 8 ) 986 - 994 2001.6
石橋明日香, 橋本昌征, 松本拓男, 野中孝昌, 三井幸雄, 池上貴久, 岡田輝政, 白川昌宏, 渡辺剛久
日本農芸化学会誌 75 63 2001.3
Structure of the methyl-CpG-binding domain of hMBD1 and its interaction with methylated DNA.
大木出, 下竹敦哉, 藤田直之, JEE J‐G, 池上貴久, 中尾光善, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 39th 104 - 105 2000.11
Conformation of a peptide ligand bound to a G-protein coupled receptor.
井ノ岡博, 大瀧哲也, 北原治, 池上貴久, 遠藤聡史, 北田千恵子, 大儀和宏, 音田治夫, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 39th 102 - 103 2000.11
Direct observation of hydrogen bonds in proteins and protein-ligand.
三島正規, 伊藤紀之, JEE J‐G, 池上貴久, 畑中稔, 横山茂之, 伊藤隆, WALCHLI M, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 39th 10 - 11 2000.11
NMR構造生物学の新技術と応用 残余双極子間相互作用と水素結合の直接観測による蛋白質の立体構造と相互作用の解析
白川昌宏, 三島正規, 伊藤紀幸, 池上貴久, 山口秀幸, 伊藤隆, WAELCHLI M
日本分光学会講演要旨集 2000 11 2000.5
Bacillus circulans WL‐12由来のキチナーゼA1を構成するドメインの立体構造と機能について
橋本昌征, 清野静香, 岡田輝政, 池上貴久, 白川昌宏, 松本拓男, 野中孝昌, 三井幸雄, 渡辺剛志
日本農芸化学会誌 74 ( 2 ) 272 2000.2
三島正規, 東史啓, 池上貴久, 秋山昌広, 真木寿治, 白川昌宏
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 22nd 323 1999.11
伊藤紀幸, 三島正規, 池上貴久, 山県ゆり子, 中別府雄作, 白川昌宏
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 22nd 323 1999.11
Bacillus circulans WL‐12由来のキチナーゼA1を構成するドメインの立体構造と機能について
橋本昌征, 清野静香, 岡田輝政, 池上貴久, 白川昌宏, 松本拓男, 野中孝昌, 三井幸雄, 渡辺剛志
日本農芸化学会関東支部受賞記念講演およびシンポジウム講演要旨集 1999 ( Oct ) 7 1999.10
Structural studies of human MTH1, a nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase.
伊藤紀幸, 三島正規, 池上貴久, 山県ゆり子, 関口睦夫, 中別府雄作, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 38th 135 1999.9
NMR studies of proteins that recognize modified bases in DNA.
三島正規, 伊藤紀幸, 大木出, 池上貴久, 秋山昌広, 真木寿治, 中別府雄作, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 38th 5 - 6 1999.9
PACAP27 in the dodecylphosphocholine(DPC) micelles.
井ノ岡博, 大瀧徹也, 池上貴久, 遠藤聡史, 北田千恵子, 大儀和宏, 音田治夫, 藤野政彦, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 38th 98 1999.9
ヌクレオチドプールの浄化に関与する酵素human MTH1の構造解析
伊藤紀幸, 三島正規, 池上貴久, 山県ゆり子, 中別府雄作, 白川昌宏
日本生物物理学会年会講演予稿集 37th S101 1999.9
三島正規, 東史啓, 池上貴久, 秋山昌広, 真木寿治, 白川昌宏
日本生物物理学会年会講演予稿集 37th S101 1999.9
λ‐Croリプレッサー蛋白質とジスルフィド結合架橋型変異体のNMR緩和時間測定による動的構造解析
山口秀幸, 佐藤滋夫, 池上貴久, 京極好正, 白川昌宏
日本生物物理学会年会講演予稿集 37th S149 1999.9
HASHIMOTO Masayuki, KATOHDA Haruhiko, SEINO Sizuka, OKADA Terumasa, IKEGAMI Takahisa, SHIRAKAWA Masahiro, MATSUMOTO Takuo, NONAKA Takamasa, MITSUI Yukio, WATANABE Takeshi
キチン・キトサン研究 5 ( 2 ) 224 - 225 1999.7
NMR Studies of the MutM.
Mishima M., Azuma F., Ikegami T., Akiyama M., Maki H., Shirakawa M.
Seibutsu Butsuri 39 ( 0 ) S101 1999
Backbone dynamics of the γ-Cro repressor protein and its mutant determined by NMR.
Yamaguchi Hideyuki, Sato Shigeo, Ikegami Takahisa, Kyogoku Yoshimasa, Shirakawa Masahiro
Seibutsu Butsuri 39 ( 0 ) S149 1999
NMR studies of the human MTH1 enzyme, a nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase
Ito N., Mishima M., Ikegami T., Yamagata Y., Nakabeppu Y., Shirakawa M.
Seibutsu Butsuri 39 ( 0 ) S101 1999
NMR study of the C-terminal phosphotransfer domain of the anaerobic sensor protein ArcB
OKADA Terumasa, HIRAYAMA Junya, IKEGAMI Takahisa, MIZUNO Takeshi, SHIRAKAWA Masahiro
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 280 - 280 1998.12
A Solution structure of Core Domain of Human MBF1
MISHIMA Masaki, OZAKI Jun, GOTO Masahide, HANDA Hiroshi, TAKEMARU Kenichi, UEDA Hitoshi, HIROSE Susumu, IKEGAMI Takahisa, SHIRAKAWA Masahiro
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 428 - 428 1998.12
NMR Study of the hDLG PDZ2 Domain and the APC C-terminal Peptide Complex
OHKI I., IKEGAMI T., AKIYAMA T., SHIRAKAWA M.
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 280 - 280 1998.12
大木出, 池上貴久, 秋山徹, 白川昌宏
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21st 280 1998.11
嫌気性センサー蛋白質ArcBのC末端リン酸転移ドメインのNMRによる構造解析
岡田輝政, 平山順也, 池上貴久, 水野猛, 白川昌宏
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21st 280 1998.11
Structures and dynamics of transcription factors.
白川昌宏, 池上貴久, 岡田輝政, 佐藤滋夫, 山口秀幸, 尾崎順, 三島正規, 京極好正
NMR討論会講演要旨集 37th 87 - 88 1998.10
NMR study of the C-terminal phosphotransfer domain of ArcB.
岡田輝政, 平山順也, 池上貴久, 水野猛, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 37th 132 - 133 1998.10
NMR Study of the hDLG PDZ2 Domain and the APC C-terminal Peptide Complex.
大木出, 池上貴久, 秋山徹, 白川昌宏
NMR討論会講演要旨集 37th 114 - 115 1998.10
Structural study of the transcriptional co-activator MBF1
Ozaki J., Masaki M., Ikegami T., Takemaru K., Ueda H., Hirose S., Goto M., Handa H., Shirakawa M.
Biophysics 38 ( 2 ) S167 1998.9
池上貴久
DNA修復欠損の分子病態 平成10年度 成果報告書 20 - 21 1998
Solution structure of the core domain of the transcriptional coactivator MBF1.
尾崎淳, 三島正規, 池上貴久, 竹丸憲一, 上田均, 広瀬進, 後藤正英, 半田宏, 白川昌宏
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 20th 199 1997.12
Structure of the DNA- and RPA-binding domain of the human DNA repair factor XPA.
白川昌宏, 池上貴久, 倉岡功, 西条将文, 小堂直彦, 田中亀代次, 森川こう右, 京極好正
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 20th 278 1997.12
Solution Structure of the hDLG PDZ2 Domain and the APC C-terminal Peptide Complex.
大木出, 池上貴久, 秋山徹, 白川昌宏
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 20th 646 1997.12
Structure of the DNA- and RPA-binding domain of the human DNA repair factor XPA.
白川昌宏, 池上貴久, 倉岡功, 西条将文, 小堂直彦, 田中亀代次, 森川こう右, 京極好正
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 20th 217 1997.12
Solution structure of the core domain of the transcriptional coactivator MBF1.
尾崎淳, 三島正規, 池上貴久, 竹丸憲一, 上田均, 広瀬進, 後藤正英, 半田宏, 白川昌宏
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 20th 368 1997.12
MISHIMA M., OZAKI Z., TAKEMARU K., IKEGAMI T., UEDA H., HIROSE S., HANDA H., SHIRAKAWA M.
Biophysics 37 S94 - 157 1997.10
NMR Study of the hDLG PDZ2 Domain and the APC C -terminal PeptideComplex
OHKI I., IKEGAMI T., AKIYAMA T., SHIRAKAWA M.
Biophysics 37 S15 - 177 1997.10
白川昌宏, 池上貴久, 田中亀代次, 森川こう右, 京極好正
NMR討論会講演要旨集 36th 28 - 29 1997.10
三島正規, 尾崎淳, 竹丸憲一, 池上貴久, 上田均, 広瀬進, 半田宏, 白川昌宏
日本生物物理学会年会講演予稿集 35th S94 1997.9
hDLG‐PDZ2ドメイン‐APC C末ペプチド複合体の構造解析
大木出, 池上貴久, 秋山徹, 白川昌宏
日本生物物理学会年会講演予稿集 35th S15 1997.9
大腸菌センサー蛋白質ArcBの持つリン酸転位ドメインのNMRによる立体構造解析
平山順也, 池上貴久, 水野猛, 白川昌宏
日本蛋白工学会年会プログラム・要旨集 9th 34 1997.5
大腸菌シグナル伝達蛋白質ArcBのヒスチジンキナーゼドメインArcBcのNMRによる構造解析
平山順也, 池上貴久, 水野猛, 白川昌宏
日本生物物理学会年会講演予稿集 34th S155 1996.10
カイコ転写メディエーターMBF1コアドメインのNMRによる構造解析
尾崎淳, 竹丸憲一, 池上貴久, 上田均, 広瀬進, 白川昌宏
日本生物物理学会年会講演予稿集 34th S67 1996.10
Structure Analysis of the C-terminal Domain of .ALPHA. Subunit of E. coli RNA Polymerase by NMR.
JEON Y, 根岸智史, 白川昌宏, 池上貴久, 京極好正, 藤田信之, 石浜明
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 17th 365 1994.11
白川昌宏, WAELCHLI M R, JEON Y H, 清水真人, 池上貴久, 京極好正
NMR討論会講演要旨集 33rd 365 - 368 1994.11
CPMGパルス系列におけるスピン状態に依存しないアーティファクトの補正方法
池上貴久
第63回NMR討論会（札幌） 2024.11
Analysis of the homodimeric structure of a D-Ala-D-Ala metallopeptidase, VanX, from vancomycin-resistant bacteria
Takahisa Ikegami
The 30th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems (ICMRBS 2024) 2024.8
Methods of uniform or site-specific deuteration of proteins and their applications to NMR analyses Invited
池上貴久
J-PARC Workshop 2022 Deuterium Science Entering a New Phase 2023.1
AX3スピン系は訳分からないけど、やはり「メチル基」様様 Invited
池上貴久
第61回NMR討論会チュートリアルコース 2022.11
Analysis of the homodimeric structure of a D-Ala-D-Ala metallopeptidase, VanX, from vancomycin-resistant bacteria Invited
池上貴久
The 7th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR第7回国際シンポジウム「NMR創薬」 2022.10
CPMG pulse sequence that cancels artifacts independently of spin states for relaxation dispersion
Takahisa Ikegami, Jun-ichi Kurita, Tsuyoshi Konuma
22nd International Society of Magnetic Resonance Conference 2021.8
病気の原因となる大きな蛋白質を磁石で観る Invited
池上貴久
夢ナビライブ 2021 2021.7
溶液 NMR パルスシーケンスの実装と応用 Invited
池上 貴久
第 30 回 高分子学会 NMR 講座 2018.10
ヌクレオチド除去修復蛋白質の立体構造解析--XPAとRPA (第1部 DNA除去修復機構とその破綻)
池上 貴久, 白川 昌宏
蛋白質核酸酵素 2001.6
池上貴久, 白川昌宏
蛋白質 核酸 酵素 2001.6
蛋白質の磁場中での配向方法 -- とくに遷移金属を用いての構造情報の取得について Invited
池上貴久
The 19th Bruker-Biospin Users’ Meeting 2002
核磁気共鳴(NMR)による蛋白質とリガンドとの相互作用の解析 Invited
池上 貴久, イケガミ タカヒサ
大阪大学低温センターだより 2004.7
池上貴久
分光研究 2004.8
大腸菌による重水素・N15・C13ラベル化法 Invited
池上貴久
日本蛋白質科学会 蛋白質科学アーカイブ 2008
SH2 domains may generally recognize a much wider region than the canonical phosphor-tyrosine International conference
池上 貴久
The 10th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR 2013.7
将来への方向性に沿った理想のNMR施設とは？ Invited
池上 貴久
蛋白質研究所セミナー「世界をリードするNMRとその科学技術・社会へのインパクト」 2013.8
池上 貴久, イケガミ タカヒサ
大阪大学低温センターだより 2009.4
磁石を使って蛋白質の構造や動きを観る Invited
池上 貴久
新潟大学 農学部 応用生命・食品科学セミナー I・集中講義（7.5 hr.） 2012.12
The analyses of protein structures, dynamics, and interactions by NMR Invited International conference
池上 貴久
Sonderforschungsbereich 642 (GTP- und ATP-abhängige Membranprozesse) 2013.1
NMRの双極子相互作用をもとにした方向情報の取得とその応用 Invited
池上 貴久
日本生物物理学会北海道支部講演会 2013.2
メチル基を通して巨大な分子を観る Invited
池上 貴久
第52回NMR討論会チュートリアルコース 2013.11
不均一サンプリング法を利用した NMR 分解能の向上 Invited
池上 貴久
生物物理学会支部講演会 2014.1
What determines the sensitivity? - the numbers of scans and sampling - Invited International conference
池上 貴久
蛋白研セミナー「非均一サンプリング NMR 測定の実際と生体高分子への応用 ~ 自在な実験デザインと研究展開 ~」 2014.6
有機低分子・生体高分子NMRの測定およびデータ処理において留意したいパラメータ Invited
池上 貴久
第 15 回 若手 NMR 研究会 2014.7
NMR基礎講座 交差相関緩和の基礎原理とTROSYなど生体高分子への応用
池上 貴久
NMR 学会誌 Vol.4 2013.10
NMR Analyses Using Residual Dipolar Coupling
長土居有隆, 池上貴久
分光研究 2015.8
磁石とラジオで分子の形を観る Invited
池上 貴久
横浜市立大学 学術院研究交流セミナー 2014.7
Cooperativity of ligand-binding observed in the protein functions including signal transduction Invited International conference
池上 貴久
IPR seminar「The 11th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR」 2014.12
Cooperativity observed in the protein functions of signal transduction Invited International conference
池上 貴久
The 4th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR 2015.2
共分散法による NMR 間接測定軸の分解能の向上について Invited
池上 貴久
大阪大学蛋白質研究所セミナー「先端核磁気共鳴から展開する生命科学研究」 2015.4
Analysis of Artifacts Derived from Pulse Imperfections in CPMG Pulse Trains International conference
池上 貴久
The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems 2016.8
Cooperativity observed in a signal transduction-related protein Invited International conference
池上 貴久
The 5th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR 第 5 回国際シンポジウム「NMR 創薬」 2016.8
基礎講座 3 : 生体系溶液 NMR の基礎 –プロダクトオペレータ- Invited
池上 貴久
第 17 回 若手 NMR 研究会 2016.9
長土居 有隆, 池上 貴久
NMR 学会誌 Vol.7 2016.10
NMR 教科書のここがよく分からない Invited
池上 貴久
第 54 回 NMR 討論会チュートリアルコース 2015.11
NMR による酵素のダイナミクスとプロトネーション Invited
池上 貴久
平成27年度第２回生物構造学研究会「中性子で観る水・生命体のダイナミクス」 2016.3
フーリエ変換を工夫して NMR スペクトルをよみがえらせる Invited
池上 貴久
第 55 回 NMR 討論会チュートリアルコース 2016.11
溶液 NMR でまずは二次元 HSQC をとってみる 〜 測定とプロセスの基礎 ～ Invited
池上 貴久
NMR セミナー「先端研究基盤共用促進事業（NMR 共用プラットフォーム）」 2017.1
NMR spin-relaxation analyses of larger molecules Invited
池上 貴久
RRR workshop 2017 Kyoto, Frontiers of NMR methods and their cutting edge applications 2017.2
緩和分散 CPMG 法におけるスピン状態に依存したアーティファクト削減の解析
池上 貴久
第56回NMR討論会 2017.11
NMR による蛋白質の立体構造解析では何が得意で逆に何が不得意か？ Invited
池上 貴久
生命医科学研究科・医学研究科連携セミナー 2018.11
A simple and effective way to suppress artifacts in CPMG experiments Invited International conference
池上 貴久
The 6th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR 第 6 回国際シンポジウム「NMR 創薬」 2018.11
ベクトルモデルだけでは駄目なのか？ Invited
池上 貴久
第 20 回 若手 NMR 研究会 2019.8
パルス不完全性を補償する 15N/13C-CPMG-HSQC パルス系列の開発
池上 貴久
第58回NMR討論会 2019.11
蛋白質の NMR 信号の帰属における信頼性向上のための安定同位体標識法の開発 Amino acid-selective unlabeling for main-chain assignment Invited
池上 貴久
Yokohama NMR CLUB 2018 2018.8
大腸菌発現系を用いた様々な特異的標識法の紹介 Invited
池上 貴久
平成 30 年度 日本分光学会 NMR 分光部会 集中講義「NMR 解析に向けた試料調製・標識・測定法〜基礎から最先端技術まで〜」 2018.10
八木 健, 池上 貴久, 森下 博文, 海津 正賢
池上 貴久, 飯泉 孝
池上 貴久, 飯泉 孝
池上 貴久, 飯泉 孝
池上 貴久, 飯泉 孝
大阪大学楠本賞
1991
Kusumoto-chancellor Prize
1991
超分子複合体の静的高分解能構造解析で可視化する環境適応原理
Grant number：23H04958 2023.4 - 2028.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A)
栗栖 源嗣, 池上 貴久, 川本 晃大
Grant amount：\194740000 （ Direct Cost: \149800000 、 Indirect Cost：\44940000 ）
Structural Analysis of a Metabolic Enzyme Complex: Insights into Coupling between Glycolysis and Fermentation
Grant number：23K05667 2023.4 - 2026.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Grant amount：\4680000 （ Direct Cost: \3600000 、 Indirect Cost：\1080000 ）
細胞膜で多彩に機能する有機化合物の合成化学的開発
Grant number：22H02211 2022.4 - 2025.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
及川 雅人, 入江 一浩, 酒井 隆一, 池上 貴久, 入江 樂, 松永 智子
Grant amount：\17420000 （ Direct Cost: \13400000 、 Indirect Cost：\4020000 ）
細胞膜で多彩に機能する有機化合物の合成化学的開発
Grant number：23K23478 2022.4 - 2025.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
及川 雅人, 酒井 隆一, 池上 貴久, 入江 樂, 松永 智子, 塚野 千尋, 入江 一浩
Grant amount：\17420000 （ Direct Cost: \13400000 、 Indirect Cost：\4020000 ）
膜透過性化合物を利用した細胞内送達技術は、新しい薬物送達の開発につながる。しかし現存の膜透過性化合物には、透過後の挙動制御や細胞毒性などに問題があり、透過効率やin vivoでの適用に限界がある。
申請者らは、細胞を致死させることなく高分子を細胞内に送達し得る天然の細胞透過ペプチドaculeine (ACU)を見出した。ACUは、カチオン性の長鎖ポリアミンと中分子ペプチドを持ち、それらが生体膜をかく乱するなどして、近傍の高分子を細胞内に送達する。本研究では、有機合成化学と細胞生物学の手法を用いてACUならびに類縁体を人為的に合成し、「活性構造」を明らかにするとともに細胞内の挙動を解析することにより、生体膜や受容体との新奇な相互作用の機構を紐解くための化学的研究を進めている。これにより、細胞に外部から働きかけて化合物を細胞内に送達する低毒性の新しいドラッグデリバリー素子や、シナプス受容体のモジュレーターの創製につなげる。
本年度は、pACU-B (LCPA-W') の液相および固相合成に成功した。液相では13量体、固相では12量体LCPAである。また、ACU-D (LCPA-W'-TFPP) の固相合成にも取り組んでいる。現在はモノマーアナログの精製を行っているところである。ACU-B (LCPA-W'-AcuPep) については、クリックケミストリーによるLCPAとAcuPepのコンジュゲート化を進めている。このケースでは、clickable AcuPepを調製し、S-S結合の異性体を分離する。一方で、ACU-B-likeライブラリーを調製するため、複数のclickable LCPAの合成を行っている。
環境に対応して機能を変えるホモ多量体酵素の動的構造変化の解析
Grant number：20K06509 2020.4 - 2023.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
池上 貴久
Grant amount：\4420000 （ Direct Cost: \3400000 、 Indirect Cost：\1020000 ）
代謝酵素の中には、通常はその本業を触媒しているが、あるきっかけにより別の機能を獲得するようなものがある。このような酵素は moon-lighting（副業）蛋白質と呼ばれており、グリセルアルデヒド３リン酸脱水素酵素（GAPDH）が、その一例としてよく知られている。
<BR>
細胞が老化してくると、活性酸素種が増え、それらが活性部位のシステイン残基を修飾する。また、老化により NAD が減少するので、補酵素である NAD が解離しはじめ、apo 体になる。これがきっかけとなって GAPDH は別の分子（蛋白質 Siah1 や mRNA など）と相互作用して別機能を獲得するようになると予想されている。しかし、その際の構造的な知見は全く得られていない。複合体の構造が一つもないことを考えると、相互作用は動的、遷移的であることが予想される。そのような特徴の相互作用を検出するため、筆者は NMR を使っている。
<BR>
この GAPDH の NMR 信号を帰属するために、2H, 15N, メチル基 13C/1H 特異的標識を行い、NMR のメチル TROSY 法を適用した結果、150 kDa という高分子量でありながら、非常に高分解能のスペクトルを得ることができた。そして各残基を変異することにより 10 個の Met および、17 個の Ile を帰属した。さらに、apo 状態の GAPDH に NAD, ATP, 酸化剤（H2O2, NOR3）, 還元型グルタチオンを加え、NMR 信号の変化を見た。さらに thermal shift assay, 分析ゲル濾過 , mass-photometry を使って構造を解析した。その結果、apo 状態、低濃度 < 1 μM, 低温 4 度において、サブユニットが解離していることを示唆する結果が得られた。さらに ATP を加えると、これが促進された。
Challenges to NMR structural analysis of higher molecular weight proteins by direct measurement of carbon nuclei
Grant number：16K14683 2016.4 - 2020.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Ikegami Takahisa
Grant amount：\3770000 （ Direct Cost: \2900000 、 Indirect Cost：\870000 ）
Analyses of proteins by nuclear magnetic resonance normally require assignment that determines the origins of signal peaks. However, the assignment becomes more difficult to achieve at higher pH conditions and for higher molecular weight proteins. In order to overcome this problem, the author tried shifting the pivot of sequential resonance assignment from the amide group 1H/15N to 1H/13C. The results showed that even with the most advanced NMR equipment, the 13C-FID sensitivity was still low and a concentration as high as 1 mM was required for analysis of high molecular weight proteins. However, 13C measurement is effective for samples with paramagnetic centers, such as metalloproteins, and intrinsically disordered proteins with no particular structure. Further progress is expected in the future with the development of pulse programs and hardware.
Development of novel materials by design of artificial proteins
Grant number：16H04779 2016.4 - 2019.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Tame Jeremy
Grant amount：\17680000 （ Direct Cost: \13600000 、 Indirect Cost：\4080000 ）
Several novel proteins have been created, and tested for their ability to self-assemble from separate subunits. Various polyoxometalate (POM) clusters and symmetrical artificial proteins of matching symmetry have been combined to build large-scale hybrid assemblies with a protein called Pizza, that we designed and described previously. The POM-Pizza interaction was measured using various biophysical techniques, and crystal structures of the complexes were solved. In a separate project, a novel lectin from a species of mussel was found to bind to the glycan of asialo-GM1. The crystal structure of this protein has been solved, and further work to develop a useful biomedical tool from this protein, by building larger networks with it, is underway.
Analysis of the mechanism of protein aggregation at an atomic level and development of a method of stabilizing it by chemical modification
Grant number：25440069 2013.4 - 2017.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Ikegami Takahisa
Grant amount：\5070000 （ Direct Cost: \3900000 、 Indirect Cost：\1170000 ）
There are many examples of proteins interacting with each other while maintaining their specific three-dimensional structures, and leading to aggregation. Such aggregation is also associated with many kinds of diseases. It is also one of the causes that hinder detailed spectroscopic analyses such as NMR. The purpose of this study is to study the physical mechanism by which such aggregation occurs spontaneously and to develop chemical modification methods that inhibit it. I have targeted VanX, an enzyme involved in vancomycin resistance in Enterococci. The tertiary structure as a dimer was analyzed mainly by NMR. As a result, it was shown that VanX aggregates to tetramers as the concentration increases. It was also found that the degree of aggregation changes depending on the solvent pH.
The molecular basis of circadian clock in plants: The origin, evolution, diversity
Grant number：25291075 2013.4 - 2017.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Ishiura Masahiro, Onai Kiyoshi, Mino Hiroyuki, Namba Keiichi, Ikegami Takahisa
Grant amount：\17680000 （ Direct Cost: \13600000 、 Indirect Cost：\4080000 ）
From cyanobacteria to human, most organisms on the earth have the circadian clock. However, clock genes, essential genes for the clock, are not conserved during evolution of organisms. In this study, we analyzed the three circadian clocks from cyanobacteria, green algae, higher plants, and revealed common and different features of these clocks. This outcome contributes to understanding the evolution of circadian clocks.
Comprehensive analysis of molecular interaction of ferredoxin and enzymes involved in redox metabolisms in chloroplast
Grant number：24370021 2012.4 - 2016.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Hase Toshiharu, IKEGAMI Takahisa, KURISU Genji
Grant amount：\18200000 （ Direct Cost: \14000000 、 Indirect Cost：\4200000 ）
We have been studying electron transfer between Fd and these enzymes by X-ray crystallography, NMR analysis and isothermal calorimetry to obtain an insight into electron partitioning in chloroplasts. In all cases, their protein-protein interactions are not so strong with Kd values around micro-molar to several tens micro-molar; a set of positively charged residues of the partner enzymes is closed to acidic residues of Fd in a spatially matching manner to produce an electrostatic interaction force. Whole acidic surface of Fd is not utilized for complex formation with partner enzymes and the interaction region appears to be at least partly unique for each enzyme. This topological variety of the molecular recognition between Fd and partner enzymes would be significant for function of Fd as a hub protein in a network of redox metabolisms.We further found the intermolecular interaction of some Fd-dependent enzymes with Fd varied when each enzyme was bound to their substrate.
NMR analysis of amyloid beta-oligomer by using molecular chaperone encapsulation system.
Grant number：23570192 2011 - 2013
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
MASARU Hoshino, IKEGAMI Takahisa
Grant amount：\5070000 （ Direct Cost: \3900000 、 Indirect Cost：\1170000 ）
Nuclear magnetic resonance spectroscopy is a powerful tool for the analysis of protein structure and dynamics in solution. This technique is, however, not able to analyze aggregated proteins and proteins which is in equilibrium in association and dissociation. To circumvent this major disadvantage, it is effective to encapsulate the target protein into the 'cage' composed of molecular chaperone from Escherichia coli. As a first step of the development of molecular chaperone encapsulating system, the long term stability of the molecular chaperone capsule was analyzed by using a green fluorescence protein as a model substrate.
Molecular design of nylon oligomer degradation enzyme and its application to bioproduction
Grant number：22360350 2010.4 - 2014.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
NEGORO Seiji, TAKEO Masahiro, KATO Dai-ichiro, HIGUCHI Yoshiki, SHIBATA Naoki, GOTO Yuji, IKEGAMI Takahisa, SHIGETA Yasuteru, KAMIYA Katsumasa
Grant amount：\19370000 （ Direct Cost: \14900000 、 Indirect Cost：\4470000 ）
Nylon hydrolase is a member of the N-terminal nucleophile hydrolase superfamily that is responsible for the degradation of nylon-6. X-ray crystallographic analysis revealed that the enzyme constitute four identical heterodimers, which resulted from the autoprocessing of the precursor protein (36 kDa). The catalytic residue of NylC was identified as the N-terminal Thr-267 of the 9-kDa subunit. Amino acid mutations at subunit interfaces of the tetramer were observed to drastically alter the thermostability of the protein. In particular, four mutations (D122G/H130Y/D36A/E263Q) of wild-type NylC enhanced the protein thermostability by 36 oC.
Development of an artificial hyperthermophilic cellulase toward a hydrolysis of crystalline cellulose.
Grant number：22570128 2010 - 2012
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
UEGAKI Koichi, NAKAMURA Tsutomu, IKEGAMI Takahisa
Grant amount：\4550000 （ Direct Cost: \3500000 、 Indirect Cost：\1050000 ）
The artificial hyperthermophilic cellulase was created by adding a hyperthermophilic carbohydrate-binding module (CBM) of chitinase from P. furiosus to the C-terminal region of hyperthermophilic cellulase of P. horikoshii. In this project, the effect of l
Structural analysis of the transient state of an enzyme active site using NMR relaxation dispersion
Grant number：21570170 2009 - 2011
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
IKEGAMI Takahisa
Grant amount：\4680000 （ Direct Cost: \3600000 、 Indirect Cost：\1080000 ）
An enzyme chitinase was aligned along the static magnetic field using Pf1-phage or acrylamide gel as an alignment medium. In this state residual dipolar coupling was observed, confirming that the system was effective for the analysis. To further apply the relaxation dispersion method to the alignment system, a complex system which was well known to be in a conformational exchange was used. Upon changing the stoichiometry in the complex, it was observed that the residual dipolar coupling also changed accordingly.
核磁気共鳴による藍色細菌時計蛋白質の相互作用とダイナミクスの研究
Grant number：19042016 2007 - 2008
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究
池上 貴久
Grant amount：\6200000 （ Direct Cost: \6200000 ）
近年、生物時計をもつ唯一の原核生物である藍色細菌において、時計に関する蛋白質KaiA, KaiB, KaiCの結晶構造が決定された。興味深いことに、よく知られている遺伝子調節の関与なしに、これらの蛋白質とATPのみで24時間のリズムがin vitroで生じる。本研究の目的は、24時間周期の鍵となるこれら3種類の蛋白質どうしの相互作用を核磁気共鳴(NMR)を用いて直接に原子レベルでリアルタイム観測し、時計発振の基本的メカニズムを解明することである。^2H,^<15>N,^<13>Cで標識したKaiA、KaiB、あるいは、KaiCを調製し、二次元NMR実験である^1H-^<15>N CRINEPTスペクトルを測定した。さらにメチル基のみを^<13>C,^1Hで標識し、それ以外の核を^<12>C,^2Hで標識した試料を調製した。この試料では、メチル基からの信号のみをメチルTROSY法を利用して測定できるので、KaiCのような超高分子量との複合体でも対応できる。KaiCにはリン酸化部位が二カ所あり、それぞれがリン酸化される順序が決まっている。そして、そのリン酸化の順序が周期の進行に同期している。そこで、それぞれのリン酸化状態を模倣した変異体を作成し、それぞれがKaiAあるいはKaiBとどのように相互作用するかを観測した。その結果、明らかにKaiCのリン酸化状態に依存してKaiB-KaiC間の相互作用が変化することが分かり、その相互作用の強さは、24時間周期の進行におけるKaiCのリン酸化、脱リン酸化の順序とほぼ一致することが見出された。一方、KaiAとKaiCの間の相互作用は、KaiCのリン酸化状態には依存しなかった。以上より、24時間周期において、KaiA, KaiB, KaiC蛋白質どうしの相互作用がどのように変化したかを原子レベルで観測でき、立体構造をもとに生物時計のメカニズムを議論することが出来た。
運動する細胞の先端に形成される浸潤装置複合体の構造と機能
Grant number：18054022 2006 - 2007
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究
村井 稔幸, 池上 貴久, 保坂 晴美
Grant amount：\7000000 （ Direct Cost: \7000000 ）
細胞運動は、癌細胞の浸潤や免疫系細胞の炎症部位への浸潤などにおいて重要である。われわれは、細胞接着レセプターCD44が、浸潤性細胞の運動先端部に集積し、膜型メタロプロテアーゼにより切断を受けること、そして、その現象が、細胞運動の駆動力を発生させることを見出した。本研究課題は、これらの独自の研究成果に基づき、浸潤装置複合体の構造と機能を明らかにすることにより、細胞運動・浸潤のメカニズムを解明することを目指した。そして、次の点について、細胞の運動先端部位に形成される浸潤装置複合体の構造と機能の解明を進めた。機能面では、臨床的に癌組織で顕著に検出される接着レセプターCD44のリガンドであるピアルロン酸の低分子量化が、浸潤性癌細胞が産生するピアルロン酸分解酵素・ヒアルロニダーゼの作用によりオートクリン様の機序で起こっており、それが浸潤装置複合体の構成を変化させることにより、細胞運動性を亢進することを明らかにした。また、癌細胞に多く発現する上皮成長因子受容体からのシグナルによっても、CD44の機能による癌細胞の運動性が亢進し、そのときに浸潤装置複合体がダイナミックに作動していることを明らかにした。構造面では、浸潤装置構成分子の大量発現、および、高純度精製を進め、溶液NMRなどによる構造解析を行い、フレキシブルに動く構造を有することを見出した。以上、CD44を中心とした細胞運動・浸潤の重要な機能調節機構が明らかとなった。
重水素交換によるプロトカドヘリンCNR-EC1とインテグリンとの相互作用の解析
Grant number：17048014 2005 - 2006
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究
池上 貴久, 八木 健
Grant amount：\5600000 （ Direct Cost: \5600000 ）
CNRは、よく知られた細胞接着分子である古典的カドヘリンとは異なり、脳神経系において特異的に発現し、免疫系と同様に体細胞突然変異を通して、多様化組織化の機能をもつ多様化膜分子群として注目されている。そのCNRのEC1ドメインをNMRで解析した。低濃度、高pHというNMR測定にとっては不利な条件であったため、距離情報や角度情報だけでなく、残余双極子相互作用から得た方向情報も加えて立体構造の精密化を行った。古典的キドヘリンの立体構造と比較してみると、全体の構造については似ていたが、機能に関わる重要な部位でかなりの相違が見られた。例えば、古典的カドヘリンにおいて相手方分子のN末端領域を収容するための疎水性ポケットが存在しないこと、また、インテグリンと相互作用すると予想されるRGD配刻を含むループ部分が存在することなどが挙げられる。上記の相違点は、古典的カドヘリンとプロトカドヘリンの機能の違いに関わる部位と予想されたので、それを追求するための機能実験を行った。N-cadherinのEC1ドメインをCNRのEC1に置換した蛋白賛は凝集活性を示さなかった。このことから、CNR-EC1はN-cadherinのEC1とは異なり、同種親和性がないことが明らかとなった。これは、上記のCNR-EC1には疎水性ポケットが存在しないことをよく説明している。また、インテグリンを生やした動物細胞はCNR-EC1と接着した。以上より、CNR-EC1は古典的カドヘリンとは異なり、同種親和性ではなく、そのRGD配列でのインテグリンとの異種親和性を通して、脳神経系の形成に寄与していることが示唆された。
新規カドヘリンファミリーCNR‐EC1のReelin相互作用による構造変化の解析
Grant number：16048218 2004
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究
池上 貴久, 八木 健
Grant amount：\2900000 （ Direct Cost: \2900000 ）
脳神経系も免疫系と同様に、多様化、組織化、記憶の機能をもつことから、脳神経系に関わる多様化分子が存在する。そのような分子の一つに、神経系のシナプス部位で特異的に発現し、体細胞突然変異を起こす細胞接着分子CNR(Cadherin-related neuronal receptor)が挙げられる。CNRはCadherin-super familyの一つで、細胞外に6個のカドヘリンドメイン(EC)、1回膜貫通領域、および細胞質領域からなる。
低濃度0.1mM、高pH8というNMR測定にとっては不利な条件ではあったが、EC1ドメイン(104残基)の立体構造を決定した。古典的N-カドヘリンと比較してみると、全体のフォールドについては、βシートからなるGreek-keyトポロジーという点では似ていた。しかし、機能に関わる重要な部位で、かなりの相違が見られた。例として、1、古典的カドヘリン同士で接着するのに関わるN末端領域、2、古典的カドヘリンにおいて前記N末端領域を収容するための相手方分子の疎水性部分および塩橋を組む部分、3、CNR-EC1を含むプロトカドヘリンだけに存在する二つのシステイン残基Cys-70とCys-76がジスルフィド結合を組んでいる点、4、インテグリンβ1と相互作用すると予想されているRGD配列(45-47)を含むループ部分、などが挙げられ、いずれも古典的カドヘリンとプロトカドヘリンの機能の違いに関わる部位である。さらに、研究分担者らは、このECIドメインがインテグリンβ1と相互作用し、細胞接着活性をもつこと、CNRの細胞外領域が、Pcdhγの細胞外領域と相互作用し、この相互作用がCNRを細胞膜上へ発現させるのに重要な働きをしていることを見出した。これらの相互作用は、古典的カドヘリンとは異なるため、立体構造の違いが相互作用の違いに反映されていると見ている。
Molecular machinery regulating energy and metabolic networks in plant cells
Grant number：15GS0320 2003 - 2007
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
HASE Toshiharu, TAKAO Toshifumi, KURISU Genji, OOSAWA Kenji, IKEGAMI Takahisa
Grant amount：\327860000 （ Direct Cost: \252200000 、 Indirect Cost：\75660000 ）
Plants synthesize various biomaterials through the reductive assimilation of inorganic carbon and nitrogen compounds. In these metabolic processes, an electron carrier protein, ferredoxin (Fd) plays a main role as an electron donor in the networks of energy and metabolic pathways. This study focused structures and functions of molecular machineries in these networks. Three projects were planed; 1) elucidation-of redox cascades via Fd in chloroplasts and nonphotosynthetic plastids, 2) determination of the structures of electron transfer complexes between Fd and partner enzymes, and 3) study of regulatory basis of these network in light of the electron partitioning.
Following results have been obtained. 1) Structures of leaf-type Fd, FNR and their complex, root-type Fd, FNR and their complex, SiR, and complex of Fd and SiR were determined by x-ray crystallographic analysis. In these 3 complexes, different molecular surface of Fd were contributed as the area for the interaction of each partner enzyme. The distances between redox centers in the complexes are different, but a through-space electron transfer seems to operate in both cases. 2) Protein-protein interaction in the complexes of Fd: FNR and Fd: SiR were elucidated by NMR analysis and the molecular recognition in solution state agrees well with that in crystal. 3) Knock-out mutant of FNR and knock-down mutant of Fd in Arabidopsis were selected. The resulting mutants, in which amounts of FNR and Fd and sub-chloroplast distribution of FNR were changed, showed an alteration in the electron partitioning between carbon and nitrogen assimilation, decrease in non-cyclic electron transfer level, and increase in reducing state level of photosystem II. These phenomena indicated the absolute amount of Fd and FNR, and their ratio are crucial factors for determination of electron availability and partitioning in chloroplasts.
酸化DNA修復酵素MutM,OGG1,MTH1の立体構造解析
Grant number：11146213 1999
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究(A)
池上 貴久, 白川 昌宏
Grant amount：\2000000 （ Direct Cost: \2000000 ）
生体内においてDNAは、通常の代謝活動によって発生する活性酸素によって損傷を受ける。その中でもグアニン塩基の酸化によって生じる8-オキソグアニンは、強力な突然変異原性をもつ。本研究では、DNA中の8-オキソグアニンの除去を行う、枯草菌由来のMutM、そのヒトホモログであるOGG1、さらに、ヌクレオチドプール内の8-オキソグアニンヌクレオチドの分解を行うMutTのヒトホモログhMTH1などの修復酵素の立体構造を核磁気共鳴法(NMR)により解析した。
まず、hMTH1においては、安定同位体である^<15>N,^<13>C核を導入し、多次元NMR測定により1,955個の距離情報、26個の水素結合情報、65個の主鎖二面角度情報を得た。これらの情報を基にsimulated annealing計算を行い、hMTH1蛋白質の立体構造を決定した(主鎖標準偏差=0.7Å)。その立体構造においては、平行βシートと逆平行βシートが並んで一枚の大きなシートを形成しており、そのシートを長いループで繋がれた2本のヘリックスが挟むように配置していた。さらに基質類似体との相互作用部位を化学シフト摂動法により解析した結果、基質は活性部位を考えられるMutTモチーフ周辺とヘリックスIIのN末端周辺と相互作用していることが分かった。次に、MutMは、単独では十分な溶解度を示さなかったため、DNAと複合体を形成させたところ測定に可能な条件を見い出した。MutM-DNA複合体は分子量が40kDaと非常に大きいため、測定感度が著しく低い。そこで蛋白質の重水素と、TROSY法を使用することにより主鎖原子核の部分的な連鎖帰属を行った。また、OGG1については、精製系を確立し二次元NMRスペクトルを測定したところ安全な構造をもたない部分があるので、プロテアーゼによる限定分解を行っている。
ヒトXPA蛋白質のRPA,及び損傷DNAとの複合体の立体構造解析
Grant number：10165216 1998
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究(A)
池上 貴久, 白川 昌宏
Grant amount：\1900000 （ Direct Cost: \1900000 ）
1、 DNA、RPA70と相互作用する部位の決定
核磁気共鳴の化学シフト摂動実験法により、ヒト遺伝子修復系蛋白質XPAの中央ドメインが、RPAの単鎖DNA結合ドメイン(RPA70_<181-422>)、あるいは、cisplatinによる損傷24-mer二本鎖DNAと結合する部位を同定した。その結果、亜鉛含有サブドメインはRPA70_<181-422>と相互作用し、C末側サブドメインのくぼみはDNAと相互作用することが分かった。従来より、転写因子などのzinc-fingerと核酸が相互作用する例が多く見い出されているが、XPAの亜鉛含有サブドメインは、蛋白質と相互作用する数少ない例の一つである。亜鉛含有サブドメインが負に帯電していることからも、DNAと静電的に反発しあうと推測できる。一方、DNAと相互作用するC末側サブドメインのくぼみは、ほぼDNAの直径と同じ大きさをもち、表面が正に帯電していることから、当結果と矛盾しないといえる。
2、 運動性の解析
アミド^<15>N核の磁化の緩和時間の測定と解析から、XPA中央ドメインの分子全体および分子内部の運動性を解析した。その結果、分子全体の溶液内での回転拡散には異方性が存在することが分かった(回転拡散テンソルの主値の比率が1.38)。構造決定された分子座標の慣性テンソルの異方性は回転拡散テンソルの異方性とよく一致した。その異方性も考慮した内部運動の解析からC末側サブドメインのくぼみ領域が非常に柔軟であることが分かった。このくぼみの柔軟性は、XPA蛋白質が構造の異なるさまざまなDNA損傷に適応して結合し、それらを認識するために必要であると考察される。
病気の原因となる大きな蛋白質を磁石で観る
Role(s)： Appearance, Lecturer, Advisor
Frompage 夢ナビライブ2021 2021.7 - 2021.10
蛋白質の立体構造から薬を創る
Role(s)： Lecturer
高大連携事業 自己形成プログラム（金沢高校リレー講座）講義 2018.10
巨大磁石でタンパク質分子の立体構造を見る
Role(s)： Lecturer, Demonstrator
Frompage 夢ナビ 2017 2017.7
タンパク質の形を磁石で観て薬を創る
Role(s)： Lecturer
明治学院高校 出張模擬授業 2015.12
世界最高峰の実験機器を体験！NMR を使って様々な現象を謎解きしてみよう！
Role(s)： Editer, Lecturer, Demonstrator
文科省 ひらめき・ときめきサイエンス 2015.8
巨大な磁石でタンパク質分子の形を見る
Role(s)： Lecturer, Demonstrator
Frompage 夢ナビ 2015 2015.7
磁石で分子や体内を観る -- NMRやMRIの原理や応用 --
Role(s)： Lecturer
理化学研究所 横浜市立大学 理化学研究所 横浜市立大学 一般公開 2014.9
未来の医療に役立つ情報を求め巨大装置 NMR でタンパク質を解析 Newspaper, magazine
株式会社スクールパートナーズ 高校生新聞 12 月号 2018.12
